More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3428 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  100 
 
 		 227 aa  464  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  96.48 
 
 		 227 aa  451  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  49.77 
 
 		 231 aa  223  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  40.18 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  44.1 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  43.59 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  43.59 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  34.62 
 
 		 239 aa  148  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  38.16 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  42.67 
 
 		 234 aa  144  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  37.1 
 
 		 240 aa  136  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  41.77 
 
 		 245 aa  136  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  38.91 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  40.09 
 
 		 243 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  40.61 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  36.92 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  34.05 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  37.07 
 
 		 239 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  34.05 
 
 		 259 aa  118  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3918  LmbE family protein  38.3 
 
 		 242 aa  118  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4435  LmbE family protein  34.96 
 
 		 244 aa  108  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  36.1 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1963  LmbE family protein  34.05 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0119223  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  32.91 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4038  conserved hypothetical protein LmbE  33.76 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  30.67 
 
 		 254 aa  96.3  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0589  LmbE family protein  36.56 
 
 		 265 aa  95.9  5e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154611  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  33.16 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  33.33 
 
 		 276 aa  94.4  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14320  uncharacterized LmbE-like protein  31.28 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00973186  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  39.1 
 
 		 271 aa  93.2  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  31.94 
 
 		 250 aa  92  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0833  LmbE family protein  31.91 
 
 		 213 aa  90.9  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14910  uncharacterized LmbE-like protein  33.33 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3452  LmbE family protein  33.03 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  30.6 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  31.9 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  33.05 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4336  LmbE family protein  32.65 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  29.33 
 
 		 308 aa  87  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  31.03 
 
 		 234 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  31.03 
 
 		 234 aa  86.3  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  31.03 
 
 		 234 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  30.6 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  31.03 
 
 		 234 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  31.03 
 
 		 234 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2878  LmbE family protein  30.6 
 
 		 246 aa  85.5  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147925  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  31.9 
 
 		 234 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  30.6 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  32.16 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0680  LmbE family protein  31.33 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  33.33 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  31.03 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2706  LmbE family protein  31.2 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  31.78 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  27.31 
 
 		 302 aa  81.6  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  31.44 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  32.34 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  34.8 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  30.74 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  33.84 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  30.57 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  33.84 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  30.57 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  27.87 
 
 		 304 aa  78.6  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  29.69 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  28.76 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  31.46 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  30.96 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  35.22 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  30.41 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  30.41 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  28.5 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  30.41 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  29.86 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  29.9 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  29.64 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  29.23 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  30.2 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  32.34 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  29.38 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  32.13 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23070  mycothiol conjugate amidase Mca  29.32 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  29.38 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  31.07 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  29.84 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  29.9 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  29.9 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  29.9 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  29.9 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  29.57 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0826  LmbE family protein  31.46 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal  0.598429 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  25.99 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  28.9 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  27.27 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  29.88 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  30.26 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  29.29 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  33.94 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  30.06 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>