125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2664 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2664  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 100 aa  202  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.530465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2732  ArsR family transcriptional regulator  83 
 
 		 100 aa  178  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  52.38 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 116 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  45.12 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  46.58 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  50.77 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  38.89 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  38.16 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  35.79 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  35.79 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  38.2 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  35.79 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  32.97 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  38.04 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 		 103 aa  51.6  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  31.33 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  34.18 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  41.79 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  33.33 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 		 105 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  31.87 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  33.82 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1723  transcriptional regulator  32 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000132397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3309  regulatory protein, ArsR  39.02 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0011324  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 		 100 aa  43.5  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  29.47 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  37.31 
 
 		 103 aa  42.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  37.31 
 
 		 164 aa  42.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  31.51 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2432  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00680056  normal  0.462104 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 109 aa  42.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  28.57 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3271  transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3570  transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0633577 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2549  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.208067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  35.62 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  38.36 
 
 		 131 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  35.71 
 
 		 336 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1274  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3422  transcriptional regulator, ArsR family  30.49 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636226  normal  0.0872067 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1541  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0806106  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 122 aa  40.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>