195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1282 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1282  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 296 aa  575  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1671  rod shape-determining protein MreC  80.41 
 
 		 296 aa  431  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575744 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1190  rod shape-determining protein MreC  45.77 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.759069  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4776  rod shape-determining protein MreC  33.22 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.17516  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0493  rod shape-determining protein MreC  32.17 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112191  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  34.26 
 
 		 274 aa  86.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  27.89 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  24.45 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  28.42 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  26.26 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  28 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  31.88 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  27.8 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  31.53 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  24.83 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  27.34 
 
 		 362 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  26 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  23.02 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  28 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2467  rod shape-determining protein MreC  30.18 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  25.73 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  28.99 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  27.6 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  27.7 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  28.07 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  29 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  26.13 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1540  rod shape-determining protein MreC  32.56 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.211291  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  30.84 
 
 		 288 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1406  rod shape-determining protein MreC  24.88 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  29.83 
 
 		 358 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  29.83 
 
 		 358 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  29.83 
 
 		 358 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1628  rod shape-determining protein MreC  25.58 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  25.35 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  29.36 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3387  Rod shape-determining protein MreC  39.31 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7281  Cell shape-determining protein-like protein  29.55 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.205543 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  34.72 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  29.36 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0852  rod shape-determining protein MreC  31.18 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0888455 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  28.94 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  28.88 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  28.38 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  24.01 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  28.64 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  20.63 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  20.63 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  25.9 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  26.46 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  27.11 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  27.8 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  27.8 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  26.76 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  24.23 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  28.29 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  29.61 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  28.17 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  28.64 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  28 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  24.31 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  29.36 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  23.4 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  28.21 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  23.05 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  26.98 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2129  rod shape-determining protein MreC  31.75 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  27.43 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0740  rod shape-determining protein MreC  21.86 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  29.89 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17471  rod shape-determining protein MreC  31.36 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  30.56 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  29.19 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  26.92 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18311  rod shape-determining protein MreC  26.86 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  22.87 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  28.09 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  28.09 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1714  rod shape-determining protein MreC  27.75 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  28.72 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  25.56 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2659  rod shape-determining protein MreC  29.77 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  28.09 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  28.09 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  28.09 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  28.09 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  28.09 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  23.27 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  28.17 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  23.77 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  23.77 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  28.17 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  28.64 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1686  rod shape-determining protein MreC  35.68 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.134471 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  26.55 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  27.75 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>