More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0100 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  54.01 
 
 		 607 aa  648    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  54.01 
 
 		 607 aa  648    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1298  GTP-binding protein TypA  55.79 
 
 		 609 aa  692    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  56.13 
 
 		 598 aa  666    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  55.07 
 
 		 615 aa  695    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  51.83 
 
 		 602 aa  639    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  53.36 
 
 		 615 aa  680    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  57.14 
 
 		 606 aa  660    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  54.29 
 
 		 598 aa  662    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  55.09 
 
 		 606 aa  655    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  54.01 
 
 		 614 aa  685    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  56.22 
 
 		 608 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  51.83 
 
 		 602 aa  639    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  53.47 
 
 		 613 aa  670    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43212  predicted protein  57.26 
 
 		 602 aa  692    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0723901  normal  0.0385264 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  55.09 
 
 		 603 aa  658    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  56.05 
 
 		 608 aa  664    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  54.01 
 
 		 614 aa  685    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  54.01 
 
 		 614 aa  685    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  54.01 
 
 		 614 aa  684    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  56.22 
 
 		 608 aa  665    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  54.58 
 
 		 608 aa  635    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  54.58 
 
 		 608 aa  635    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4094  GTP-binding protein TypA  54.18 
 
 		 607 aa  636    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1224  GTP-binding protein TypA  53.76 
 
 		 605 aa  638    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  54.34 
 
 		 614 aa  686    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2456  GTP-binding protein TypA  53.16 
 
 		 650 aa  635    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  56.51 
 
 		 598 aa  664    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  56.93 
 
 		 606 aa  660    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1109  small GTP-binding protein  54.98 
 
 		 622 aa  684    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0657709  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  52.81 
 
 		 610 aa  643    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0554  small GTP-binding protein  52.72 
 
 		 614 aa  647    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  56.25 
 
 		 596 aa  666    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  56.22 
 
 		 608 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  55.98 
 
 		 609 aa  647    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00590  GTPase  54.17 
 
 		 609 aa  642    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  55.81 
 
 		 602 aa  694    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  55.76 
 
 		 608 aa  665    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  52.07 
 
 		 610 aa  637    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  56.51 
 
 		 600 aa  667    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  51.9 
 
 		 608 aa  635    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  57.71 
 
 		 602 aa  677    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  54.45 
 
 		 598 aa  654    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0169  GTP-binding protein TypA  53.91 
 
 		 607 aa  636    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  54.01 
 
 		 614 aa  685    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2316  GTP-binding protein TypA  54.18 
 
 		 609 aa  646    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  55.04 
 
 		 598 aa  661    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  56.83 
 
 		 597 aa  668    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  56.4 
 
 		 603 aa  668    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  52 
 
 		 602 aa  640    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  58.5 
 
 		 592 aa  691    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  56.22 
 
 		 608 aa  664    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  54.02 
 
 		 615 aa  650    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  58.52 
 
 		 608 aa  711    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  54.7 
 
 		 609 aa  639    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  57.53 
 
 		 600 aa  668    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  59.54 
 
 		 614 aa  750    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  94.72 
 
 		 627 aa  1154    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  54.52 
 
 		 610 aa  654    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  56.42 
 
 		 596 aa  669    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  53.33 
 
 		 603 aa  636    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  55 
 
 		 608 aa  660    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  54.42 
 
 		 603 aa  640    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0239  GTP-binding protein TypA  54.38 
 
 		 608 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  55.65 
 
 		 600 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  54.76 
 
 		 603 aa  651    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2024  GTP-binding protein TypA  55.59 
 
 		 607 aa  654    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  56.4 
 
 		 605 aa  671    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  58.42 
 
 		 593 aa  697    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  56.68 
 
 		 598 aa  667    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  54.7 
 
 		 609 aa  639    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  55.93 
 
 		 608 aa  666    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  53.57 
 
 		 623 aa  643    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  56.05 
 
 		 608 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  56.22 
 
 		 608 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  55.65 
 
 		 610 aa  687    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  55.81 
 
 		 610 aa  686    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  52.96 
 
 		 616 aa  639    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  57.09 
 
 		 596 aa  691    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  54.76 
 
 		 603 aa  650    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  54.76 
 
 		 603 aa  650    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  57.96 
 
 		 602 aa  659    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  54.76 
 
 		 603 aa  651    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  55.07 
 
 		 615 aa  695    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  55.76 
 
 		 608 aa  665    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  53.49 
 
 		 605 aa  637    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2298  membrane GTPase for stress response  53.8 
 
 		 613 aa  664    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  53.49 
 
 		 605 aa  638    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1181  stress response membrane GTPase  51.32 
 
 		 618 aa  644    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0076831  hitchhiker  0.00656826 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  54.87 
 
 		 598 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  55.78 
 
 		 615 aa  689    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  55.93 
 
 		 608 aa  666    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  55.08 
 
 		 594 aa  650    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  55.29 
 
 		 599 aa  657    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  54.92 
 
 		 603 aa  654    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0028  GTP-binding protein TypA/BipA  54.27 
 
 		 607 aa  645    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  54.77 
 
 		 601 aa  655    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 613 aa  1232    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  54.83 
 
 		 607 aa  647    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  56.22 
 
 		 608 aa  665    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>