More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4411 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  70.93 
 
 		 700 aa  955    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 712 aa  1390    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  58.76 
 
 		 715 aa  778    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  59.48 
 
 		 715 aa  793    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  43.93 
 
 		 710 aa  481  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  40.72 
 
 		 725 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  40.06 
 
 		 705 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  39.66 
 
 		 703 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  38.18 
 
 		 699 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  37.38 
 
 		 708 aa  395  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  36.03 
 
 		 696 aa  376  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  36.91 
 
 		 711 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  34.95 
 
 		 750 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  37.81 
 
 		 704 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  37.15 
 
 		 698 aa  366  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  33.57 
 
 		 702 aa  365  1e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  34.84 
 
 		 707 aa  362  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  32.82 
 
 		 703 aa  362  1e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  34.18 
 
 		 697 aa  359  8e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  33.05 
 
 		 702 aa  359  8e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  38.24 
 
 		 700 aa  358  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  37.38 
 
 		 712 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  34.48 
 
 		 700 aa  357  5e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  37.08 
 
 		 698 aa  357  5e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  33.52 
 
 		 696 aa  356  1e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  34.25 
 
 		 892 aa  354  4e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.08 
 
 		 711 aa  352  1e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  36.85 
 
 		 698 aa  352  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  34.04 
 
 		 706 aa  351  3e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  34.33 
 
 		 704 aa  351  3e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  36.34 
 
 		 710 aa  343  4e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  35.52 
 
 		 697 aa  343  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  33.85 
 
 		 700 aa  343  9e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  35.19 
 
 		 695 aa  340  5.9999999999999996e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  35.37 
 
 		 711 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  31.28 
 
 		 706 aa  339  9.999999999999999e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.52 
 
 		 699 aa  339  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  32.03 
 
 		 711 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 695 aa  338  2.9999999999999997e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.94 
 
 		 699 aa  335  2e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  34.06 
 
 		 669 aa  334  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  35.26 
 
 		 692 aa  333  9e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  34.35 
 
 		 897 aa  331  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5367  putative acyl-CoA synthetase  36.66 
 
 		 715 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  34.48 
 
 		 697 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  34.13 
 
 		 889 aa  327  3e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  34.33 
 
 		 711 aa  328  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  30.35 
 
 		 712 aa  328  3e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  31.21 
 
 		 698 aa  328  3e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  33.24 
 
 		 895 aa  326  9e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  34.51 
 
 		 718 aa  323  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.65 
 
 		 929 aa  323  7e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  33.47 
 
 		 698 aa  323  9.000000000000001e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  34.13 
 
 		 703 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  34.65 
 
 		 704 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  33.81 
 
 		 702 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  34.69 
 
 		 709 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  36.24 
 
 		 699 aa  320  6e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  34.47 
 
 		 893 aa  320  6e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  35.28 
 
 		 741 aa  318  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  32.7 
 
 		 728 aa  318  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  35.39 
 
 		 718 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  30.88 
 
 		 714 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3421  CoA-binding domain protein  37.65 
 
 		 690 aa  314  4.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.678339  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  28.93 
 
 		 701 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  33.05 
 
 		 892 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  30.9 
 
 		 905 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  33.38 
 
 		 697 aa  307  6e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  34.49 
 
 		 893 aa  306  9.000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3321  CoA-binding domain-containing protein  33.52 
 
 		 703 aa  306  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776977  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  30.57 
 
 		 921 aa  303  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  35.96 
 
 		 897 aa  302  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  31.44 
 
 		 911 aa  301  3e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  31.17 
 
 		 912 aa  299  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4844  CoA-binding domain-containing protein  35.45 
 
 		 693 aa  298  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0385105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  31.37 
 
 		 915 aa  297  5e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1907  CoA-binding  35.17 
 
 		 699 aa  296  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805485  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  32.23 
 
 		 900 aa  296  8e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  34.41 
 
 		 709 aa  294  4e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.89 
 
 		 660 aa  291  2e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  33.19 
 
 		 695 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  34.63 
 
 		 729 aa  291  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1905  putative acyl-CoA synthetase  35.42 
 
 		 718 aa  291  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1885  CoA-binding domain-containing protein  31.71 
 
 		 708 aa  290  8e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  34.51 
 
 		 705 aa  289  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  36.53 
 
 		 716 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1097  CoA-binding domain-containing protein  35.52 
 
 		 702 aa  288  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  32.37 
 
 		 715 aa  287  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  34.48 
 
 		 693 aa  287  5e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  32.43 
 
 		 904 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 		 903 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  33.84 
 
 		 911 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  33.75 
 
 		 890 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  33.42 
 
 		 903 aa  280  6e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  33.8 
 
 		 699 aa  280  6e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  31.41 
 
 		 913 aa  280  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  34.99 
 
 		 714 aa  273  9e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1760  acetyltransferase  29.99 
 
 		 911 aa  269  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0308068 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  32.78 
 
 		 893 aa  267  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  29.22 
 
 		 898 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>