More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1008 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  592  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  81.09 
 
 		 308 aa  457  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67.99 
 
 		 311 aa  359  4e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67 
 
 		 311 aa  338  8e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  67.33 
 
 		 312 aa  315  7e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  57 
 
 		 309 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  56.31 
 
 		 309 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  57.34 
 
 		 309 aa  291  8e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  58.3 
 
 		 397 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  57.68 
 
 		 309 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  57.68 
 
 		 309 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  57.68 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  59.09 
 
 		 402 aa  269  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  60.28 
 
 		 356 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  60.28 
 
 		 356 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  60.28 
 
 		 356 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  60.28 
 
 		 356 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  59.93 
 
 		 353 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  59.93 
 
 		 356 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  59.93 
 
 		 356 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  48.55 
 
 		 305 aa  203  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  47.41 
 
 		 302 aa  177  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  37.76 
 
 		 289 aa  162  7e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.21 
 
 		 298 aa  160  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  35.49 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.14 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.72 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.45 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.18 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5553  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  27.46 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.94 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  35.42 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  30.33 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  26.01 
 
 		 296 aa  96.3  7e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  29.32 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  25.17 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  28.57 
 
 		 300 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.52 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.15 
 
 		 309 aa  89.4  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  30.31 
 
 		 281 aa  89  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.14 
 
 		 289 aa  89  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  32.99 
 
 		 309 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  29.19 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  28.48 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  31.29 
 
 		 319 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  24.75 
 
 		 303 aa  86.3  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  29.92 
 
 		 309 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  30.04 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  29.37 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  26.56 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  31.82 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  33.77 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  29.64 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  27.08 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  30.2 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  31.23 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  30.54 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0562  hypothetical protein  28.24 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.368396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  24.44 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.97 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  29.77 
 
 		 532 aa  77  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  29.87 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.57 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.42 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  28.16 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.76 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  25.94 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1225  hypothetical protein  32.51 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  28.24 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.9 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  27.69 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.4 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  25.63 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.69 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.82 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  24.23 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  28.76 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.24 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2384  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.42 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.96 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0333  hypothetical protein  29.47 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.950508 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  24.01 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2187  hypothetical protein  30.06 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0754091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  26.07 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.35 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3236  hypothetical protein  28.28 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  28.93 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  29.73 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  25.65 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  27.81 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  28.62 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  28.62 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.81 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  29.96 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.79 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  26.92 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>