More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1383 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 478 aa  962    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  53.59 
 
 		 477 aa  458  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  51.27 
 
 		 511 aa  415  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  41.56 
 
 		 536 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4279  multicopper oxidase type 3  59.25 
 
 		 545 aa  311  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  41.51 
 
 		 489 aa  310  4e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  41.6 
 
 		 508 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  39.84 
 
 		 498 aa  309  6.999999999999999e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  39.58 
 
 		 521 aa  301  2e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  39.54 
 
 		 521 aa  296  6e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  40.38 
 
 		 513 aa  289  7e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  38.48 
 
 		 551 aa  282  9e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  32.89 
 
 		 544 aa  278  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  33.15 
 
 		 546 aa  278  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  34.26 
 
 		 554 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  34.26 
 
 		 554 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  34 
 
 		 549 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  33.86 
 
 		 546 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  33.67 
 
 		 551 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  33.67 
 
 		 551 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  35.28 
 
 		 527 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  32.41 
 
 		 551 aa  266  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  37.45 
 
 		 506 aa  266  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  35.73 
 
 		 504 aa  259  6e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  38.41 
 
 		 521 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  36.13 
 
 		 518 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  36.42 
 
 		 518 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  32.28 
 
 		 565 aa  229  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  33.33 
 
 		 556 aa  217  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  31.29 
 
 		 561 aa  209  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  32.59 
 
 		 568 aa  207  3e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1132  multicopper oxidase, type 2  36.02 
 
 		 504 aa  206  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  31.57 
 
 		 568 aa  205  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  30.98 
 
 		 705 aa  204  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  30.82 
 
 		 568 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  33.53 
 
 		 476 aa  195  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  30.59 
 
 		 513 aa  193  4e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  31.44 
 
 		 515 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  34.62 
 
 		 460 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  34.14 
 
 		 456 aa  189  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  33.11 
 
 		 468 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  33.69 
 
 		 497 aa  188  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  32.6 
 
 		 460 aa  187  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  32.66 
 
 		 459 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  31.96 
 
 		 464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  31.96 
 
 		 464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  30.48 
 
 		 564 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  32.06 
 
 		 463 aa  183  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  29.76 
 
 		 460 aa  182  9.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  30.16 
 
 		 460 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  33.03 
 
 		 460 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  32.06 
 
 		 463 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  32.51 
 
 		 483 aa  179  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  31.33 
 
 		 434 aa  179  9e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  31.33 
 
 		 434 aa  179  9e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  33.04 
 
 		 461 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  31.5 
 
 		 457 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  33.43 
 
 		 638 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  31.34 
 
 		 457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  32.6 
 
 		 592 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3882  twin-arginine translocation pathway signal  30.96 
 
 		 499 aa  170  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  31.85 
 
 		 456 aa  170  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0346  CopA family copper resistance protein  37.74 
 
 		 599 aa  167  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.513863  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  36.98 
 
 		 594 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  36.8 
 
 		 621 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  32.45 
 
 		 672 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  32.45 
 
 		 642 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  35.35 
 
 		 607 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3235  multicopper oxidase type 2  31.87 
 
 		 502 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00405  Multicopper oxidase  37.15 
 
 		 604 aa  163  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  35.36 
 
 		 657 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  32.01 
 
 		 601 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  34.35 
 
 		 621 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  32.01 
 
 		 601 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  35.65 
 
 		 656 aa  161  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  38.58 
 
 		 606 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  35.69 
 
 		 604 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  30.41 
 
 		 437 aa  160  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  31.81 
 
 		 664 aa  160  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  33.42 
 
 		 605 aa  160  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  34.48 
 
 		 373 aa  159  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  36.64 
 
 		 505 aa  159  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  36.28 
 
 		 563 aa  159  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  31.88 
 
 		 580 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  31.41 
 
 		 619 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0784  copper-resistance protein CopA  35.76 
 
 		 590 aa  158  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0126  CopA family copper resistance protein  36.63 
 
 		 569 aa  157  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  36.58 
 
 		 584 aa  157  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  35.75 
 
 		 579 aa  157  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  32.5 
 
 		 605 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  33.98 
 
 		 611 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  32.14 
 
 		 809 aa  155  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  32.35 
 
 		 669 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  31.28 
 
 		 671 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1573  copper-resistance protein CopA  30.64 
 
 		 664 aa  154  5e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  32.08 
 
 		 652 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  32.08 
 
 		 652 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09170  conserved hypothetical protein: exracellular laccase (Eurofung)  28.71 
 
 		 570 aa  153  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2116  copper-resistance protein CopA  30.95 
 
 		 666 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  33.51 
 
 		 566 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>