More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0963 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 608 aa  1228    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  46.66 
 
 		 610 aa  599  1e-170  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  43.99 
 
 		 629 aa  558  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  44.62 
 
 		 623 aa  561  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  44.16 
 
 		 630 aa  540  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  42.81 
 
 		 626 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  41.99 
 
 		 617 aa  518  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  42.65 
 
 		 624 aa  514  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  42.93 
 
 		 626 aa  511  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  42.11 
 
 		 622 aa  508  9.999999999999999e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  40.74 
 
 		 644 aa  502  1e-141  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  42.52 
 
 		 624 aa  499  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  43.02 
 
 		 628 aa  501  1e-140  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0211  DNA mismatch repair protein MutL  39.69 
 
 		 644 aa  494  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  41.18 
 
 		 629 aa  489  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2145  DNA mismatch repair protein MutL  37.58 
 
 		 612 aa  434  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000372508  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  54.55 
 
 		 685 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0412  DNA mismatch repair protein MutL  37.46 
 
 		 618 aa  393  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  39.38 
 
 		 622 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  38.58 
 
 		 628 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  39.81 
 
 		 620 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  39.12 
 
 		 606 aa  372  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  38.54 
 
 		 612 aa  368  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  36.45 
 
 		 641 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  36.96 
 
 		 603 aa  367  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  39.2 
 
 		 565 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  37.7 
 
 		 633 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  37.64 
 
 		 632 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  38.09 
 
 		 628 aa  362  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  37.38 
 
 		 632 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  38.33 
 
 		 629 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  37.46 
 
 		 611 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  36.6 
 
 		 616 aa  356  5e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  36.35 
 
 		 647 aa  357  5e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  35.94 
 
 		 559 aa  356  7.999999999999999e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  37.6 
 
 		 602 aa  355  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  36.5 
 
 		 640 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  38.07 
 
 		 645 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  37.76 
 
 		 648 aa  349  8e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  37.4 
 
 		 612 aa  349  9e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  33.33 
 
 		 644 aa  348  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  34.25 
 
 		 661 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  36.32 
 
 		 633 aa  347  5e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  39.53 
 
 		 560 aa  347  5e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  34.51 
 
 		 647 aa  346  6e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  37.24 
 
 		 625 aa  343  5e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  37.22 
 
 		 632 aa  343  5e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  36.19 
 
 		 623 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  35.91 
 
 		 602 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  35.84 
 
 		 615 aa  342  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  33.55 
 
 		 614 aa  342  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  37.48 
 
 		 621 aa  342  2e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  36.41 
 
 		 622 aa  340  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  34.13 
 
 		 613 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  36.49 
 
 		 633 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  36.16 
 
 		 635 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  35.98 
 
 		 636 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  36.97 
 
 		 635 aa  339  7e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  37.78 
 
 		 605 aa  339  7e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  34.7 
 
 		 631 aa  339  8e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  36.02 
 
 		 633 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  36.06 
 
 		 647 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  34.4 
 
 		 572 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  36.52 
 
 		 622 aa  337  3.9999999999999995e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  36.79 
 
 		 605 aa  337  5e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  38.23 
 
 		 626 aa  336  7e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  34.39 
 
 		 667 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  37.32 
 
 		 619 aa  335  1e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  34.65 
 
 		 630 aa  335  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  35.98 
 
 		 641 aa  335  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  36.29 
 
 		 644 aa  335  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  34.24 
 
 		 667 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  34.4 
 
 		 661 aa  335  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  34.24 
 
 		 667 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  35.52 
 
 		 635 aa  333  4e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  37.48 
 
 		 611 aa  333  7.000000000000001e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  35 
 
 		 608 aa  333  8e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  37.99 
 
 		 601 aa  332  9e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  35.25 
 
 		 598 aa  332  1e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  34.31 
 
 		 655 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  33.13 
 
 		 649 aa  331  3e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  33.07 
 
 		 626 aa  330  4e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  33.07 
 
 		 626 aa  330  4e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  37.52 
 
 		 628 aa  330  4e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  36.11 
 
 		 566 aa  329  7e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  35.05 
 
 		 619 aa  329  8e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  35.7 
 
 		 575 aa  328  1.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  32.41 
 
 		 644 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  36.12 
 
 		 605 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  34.91 
 
 		 594 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  34.36 
 
 		 652 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  37.3 
 
 		 612 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  32.4 
 
 		 647 aa  328  2.0000000000000001e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  36.71 
 
 		 574 aa  327  3e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  36.73 
 
 		 620 aa  327  3e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  37.07 
 
 		 589 aa  327  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  32.26 
 
 		 647 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  38.19 
 
 		 607 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  32.11 
 
 		 647 aa  327  5e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  35.43 
 
 		 644 aa  327  5e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>