103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1277 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 167 aa  345  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  85.47 
 
 		 172 aa  284  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  46.2 
 
 		 172 aa  144  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  44.23 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  39.41 
 
 		 171 aa  134  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  40.62 
 
 		 163 aa  134  7.000000000000001e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  42.26 
 
 		 172 aa  134  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  44.38 
 
 		 167 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  43.75 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1458  cupin 2 domain-containing protein  42.24 
 
 		 174 aa  127  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  41.61 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0568  cupin 2 domain-containing protein  42.42 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1917  hypothetical protein  41.72 
 
 		 172 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0814  cupin 2 protein  41.32 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.89 
 
 		 172 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  38.46 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.27 
 
 		 172 aa  90.5  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  40.91 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1110  cupin 2, barrel  34.82 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.82 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  34.82 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.14 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  35.14 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.21 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.6 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.38 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.21 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  34.21 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1696  cupin 2 protein  35.71 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3626  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.76 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.06 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  37.84 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  29.76 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.67 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.65 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  34.95 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  27.89 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  30.07 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  36.63 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  34.62 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.67 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0602591  normal  0.755419 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  25.95 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  36.63 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  36.63 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  36.63 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  26.15 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  32.32 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  32.32 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  32.32 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  32.32 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  34.65 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  34.65 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  33.01 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  25.66 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.81 
 
 		 332 aa  53.9  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0887  hypothetical protein  31.31 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1854  hypothetical protein  31.31 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.1 
 
 		 181 aa  52  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.29 
 
 		 160 aa  51.2  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 154 aa  51.2  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  23.58 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02768  cupin region  27.73 
 
 		 129 aa  49.7  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.711044  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.88 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.29 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  24 
 
 		 152 aa  48.5  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  40.78 
 
 		 333 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  26.89 
 
 		 157 aa  48.5  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  29.82 
 
 		 153 aa  48.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2394  cupin 2 domain-containing protein  30.68 
 
 		 151 aa  48.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00264239  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3273  methionyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 		 662 aa  47.4  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  29.13 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2355  hypothetical protein  27.27 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  27.55 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.58 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.6 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2501  hypothetical protein  26.26 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 126 aa  45.1  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.66 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.03 
 
 		 160 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4979  cupin region  26.05 
 
 		 155 aa  44.3  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  35 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3086  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.91 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.097702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6318  Methionine--tRNA ligase  27.45 
 
 		 662 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2981  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.91 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2894  cupin 2 domain-containing protein  28.91 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  30.63 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.76 
 
 		 104 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4857  cupin domain-containing protein  27.84 
 
 		 157 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0286871 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2020  cupin 2, barrel  29.63 
 
 		 155 aa  42  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434776 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  35.14 
 
 		 115 aa  42  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3060  cupin 2 domain-containing protein  27.61 
 
 		 149 aa  42  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975792 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0441  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.53 
 
 		 132 aa  42  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0344  catalase-2  34.38 
 
 		 676 aa  42  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3146  cupin 2 protein  26.26 
 
 		 160 aa  41.6  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4605  catalase  32.81 
 
 		 675 aa  41.6  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.74 
 
 		 115 aa  41.2  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.15 
 
 		 150 aa  41.2  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  33.82 
 
 		 108 aa  40.8  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>