More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0609 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.224785 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  96.47 
 
 
255 aa  477  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.618168  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5975  NAD/NADP dependent oxidoreductase  89.02 
 
 
255 aa  438  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2755  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.65 
 
 
259 aa  341  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.910839 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.41 
 
 
255 aa  336  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.432409 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.46 
 
 
259 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.947162  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.46 
 
 
259 aa  332  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2051  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.06 
 
 
255 aa  308  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.641389  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.31 
 
 
279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6170  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.78 
 
 
268 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.343653 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
254 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.535154 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.41 
 
 
250 aa  185  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 
250 aa  185  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
251 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
258 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.08 
 
 
256 aa  175  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
254 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.08 
 
 
247 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214979  normal  0.444362 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.31 
 
 
251 aa  170  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
254 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0940  putative short-chain dehydrogenase  41.22 
 
 
266 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2957  putative short-chain dehydrogenase/reductase  41.31 
 
 
247 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
255 aa  164  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
255 aa  164  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5514  cyclopentanol dehydrogenase  40.46 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
252 aa  162  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
261 aa  162  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
262 aa  161  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
250 aa  162  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.165554 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
249 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
283 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
251 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000407954 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
250 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
250 aa  159  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
271 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224446 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
254 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 
254 aa  156  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  40.78 
 
 
257 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
257 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 
249 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2045  short chain dehydrogenase  38.04 
 
 
272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  36.19 
 
 
255 aa  155  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
253 aa  155  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
267 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
253 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
250 aa  155  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
251 aa  155  8e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.2 
 
 
246 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
253 aa  154  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
250 aa  153  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553116  normal  0.644711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1871  short chain dehydrogenase  37.15 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
272 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
272 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  39.13 
 
 
251 aa  152  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
249 aa  152  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.8 
 
 
246 aa  152  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1400  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 
264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.473326  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
260 aa  152  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1358  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.06 
 
 
255 aa  152  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.3 
 
 
246 aa  151  8e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2351  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.37 
 
 
252 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.647461  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
244 aa  151  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1604  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.15 
 
 
247 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
252 aa  151  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  38.43 
 
 
257 aa  151  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  39.38 
 
 
253 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
249 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.731962 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1817  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 
264 aa  149  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.3 
 
 
246 aa  149  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
244 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00509935 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  36.11 
 
 
247 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  36.98 
 
 
259 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  37.35 
 
 
257 aa  149  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
247 aa  149  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.585241  normal  0.0114993 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
252 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
267 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0435882  hitchhiker  0.0000139106 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
257 aa  148  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.86 
 
 
244 aa  148  6e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
261 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
251 aa  148  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6540  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.46 
 
 
312 aa  148  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
251 aa  148  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
244 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
254 aa  148  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0065631  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4827  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 
295 aa  148  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.19 
 
 
252 aa  148  9e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0620  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
254 aa  148  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  35.71 
 
 
247 aa  148  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2567  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.19 
 
 
252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>