More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5280 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5280  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
448 aa  922    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4836  FAD dependent oxidoreductase  91.07 
 
 
448 aa  847    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0458657 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3065  hypothetical protein  64.73 
 
 
448 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0139193  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7256  oxidoreductase  63.39 
 
 
448 aa  586  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4005  oxidoreductase, NAD-binding site  46.1 
 
 
446 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0756508  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4774  FAD dependent oxidoreductase  43.57 
 
 
448 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.952242  normal  0.115123 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4822  FAD dependent oxidoreductase  43.34 
 
 
448 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537727  normal  0.272998 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4751  FAD dependent oxidoreductase  44.84 
 
 
447 aa  361  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563662  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4112  FAD dependent oxidoreductase  35.12 
 
 
439 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09750  putative oxidoreductase  35.29 
 
 
439 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6865  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 
443 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156047  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1374  FAD dependent oxidoreductase  33.78 
 
 
439 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5757  FAD dependent oxidoreductase  35.31 
 
 
443 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2818  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 
439 aa  250  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001295  glycine/D-amino acid oxidase  31.61 
 
 
438 aa  250  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5370  oxidoreductase-related protein  34.47 
 
 
442 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.195 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2113  putative oxidoreductase protein  34.02 
 
 
387 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0578145  normal  0.36209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2297  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 
446 aa  229  5e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4199  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 
437 aa  226  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4482  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 
437 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1106  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 
439 aa  218  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2476  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
430 aa  179  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.326489  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
472 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 
470 aa  123  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 
473 aa  120  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 
464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  26.68 
 
 
482 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4329  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 
453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4439  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 
453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  0.839002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  25.76 
 
 
427 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 
427 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 
480 aa  109  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  25.44 
 
 
427 aa  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 
459 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  26.67 
 
 
431 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 
431 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 
434 aa  108  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 
431 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  27.04 
 
 
473 aa  103  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 
469 aa  103  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  24.44 
 
 
494 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 
423 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 
426 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 
433 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 
462 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0887  putative FAD-binding oxidoreductase  26.49 
 
 
426 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  25.23 
 
 
482 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 
487 aa  101  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 
425 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3264  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
427 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2980  FAD dependent oxidoreductase  26.93 
 
 
435 aa  101  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104228  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  25.19 
 
 
427 aa  100  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  24.76 
 
 
433 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  25.19 
 
 
427 aa  99  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  25.87 
 
 
437 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  24 
 
 
494 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  24 
 
 
494 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
496 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 
424 aa  97.8  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 
432 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  25.3 
 
 
468 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  25.3 
 
 
468 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2849  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 
426 aa  97.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 
437 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 
431 aa  96.7  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  25.8 
 
 
428 aa  96.7  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  23.24 
 
 
470 aa  96.3  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
433 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 
431 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 
472 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 
429 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  23.97 
 
 
486 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 
428 aa  94.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  25.12 
 
 
424 aa  94.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 
425 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 
428 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 
428 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  23.82 
 
 
465 aa  93.6  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  24.69 
 
 
428 aa  93.2  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 
430 aa  93.2  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  24.76 
 
 
443 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 
463 aa  93.2  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 
463 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 
428 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  22.74 
 
 
465 aa  92.4  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 
425 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 
437 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  23.32 
 
 
434 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  24.71 
 
 
464 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  23.99 
 
 
455 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 
428 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2808  oxidoreductase, putative  25.63 
 
 
455 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479983  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 
483 aa  91.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 
442 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 
423 aa  90.9  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 
463 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 
428 aa  90.9  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 
436 aa  90.9  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  25.77 
 
 
465 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>