More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5194 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
169 aa  339  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  85.21 
 
 
169 aa  295  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  76.92 
 
 
168 aa  271  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  76.79 
 
 
167 aa  263  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  62.35 
 
 
168 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  62.13 
 
 
166 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  59.52 
 
 
167 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  58.18 
 
 
165 aa  194  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  56.29 
 
 
171 aa  190  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  56.29 
 
 
172 aa  189  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  58.08 
 
 
166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  51.16 
 
 
185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  51.16 
 
 
185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  55.36 
 
 
166 aa  176  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  55.36 
 
 
166 aa  176  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  52.33 
 
 
173 aa  174  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  49.41 
 
 
166 aa  166  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  49.11 
 
 
162 aa  166  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  44.38 
 
 
164 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  47.62 
 
 
164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  49.32 
 
 
204 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  40.94 
 
 
163 aa  124  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  48.3 
 
 
194 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 
189 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  44.93 
 
 
189 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  43.92 
 
 
189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  43.84 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  42.75 
 
 
189 aa  108  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  41.61 
 
 
176 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  36.24 
 
 
142 aa  106  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  40.91 
 
 
177 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  43.31 
 
 
175 aa  99.8  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  34.87 
 
 
156 aa  97.8  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  35.5 
 
 
156 aa  97.8  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  36.99 
 
 
180 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  39.72 
 
 
158 aa  96.7  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  34.48 
 
 
198 aa  95.9  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  34.87 
 
 
147 aa  95.1  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  34.87 
 
 
147 aa  95.1  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  39.51 
 
 
150 aa  94.7  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  38.61 
 
 
185 aa  93.6  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  42.03 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  38.16 
 
 
231 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  39.84 
 
 
142 aa  92.8  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  36.18 
 
 
158 aa  92  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
186 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  37.41 
 
 
155 aa  91.7  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  35.09 
 
 
158 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  35.09 
 
 
158 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  31.36 
 
 
166 aa  90.1  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 
147 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  39.19 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 
147 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  36.09 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  38.16 
 
 
173 aa  89  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 
144 aa  88.6  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 
145 aa  88.6  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  36.69 
 
 
148 aa  88.2  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  41.35 
 
 
187 aa  88.2  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  35.82 
 
 
158 aa  87.8  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  40.15 
 
 
211 aa  87.8  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  36.69 
 
 
148 aa  87.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
218 aa  87.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  36.62 
 
 
134 aa  86.7  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  40.6 
 
 
187 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  40.79 
 
 
181 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  40.79 
 
 
181 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  32.37 
 
 
146 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  31.61 
 
 
197 aa  87  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  34.27 
 
 
176 aa  87  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 
155 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 
154 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  33.81 
 
 
156 aa  85.1  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  33.78 
 
 
142 aa  85.1  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  40.15 
 
 
157 aa  85.5  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  33.76 
 
 
164 aa  84.3  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 
147 aa  84.3  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
149 aa  84.3  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  34.69 
 
 
164 aa  84  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  33.82 
 
 
146 aa  84  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  32.62 
 
 
173 aa  82  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  43.81 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  38.97 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  34.03 
 
 
134 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  37.33 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  39.71 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  34.72 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4589  hypothetical protein  76.47 
 
 
67 aa  81.6  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.780725 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3063  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  34.93 
 
 
147 aa  80.9  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  36.62 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  34.07 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3064  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  37.66 
 
 
141 aa  80.1  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  36.57 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>