More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5066 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5066  Cystathionine gamma-lyase  100 
 
 
401 aa  823    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19090  cystathionine gamma-synthase  69.85 
 
 
401 aa  578  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.438535 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1986  Cystathionine gamma-lyase  63.99 
 
 
390 aa  513  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0258537  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0098  cystathionine gamma-synthase  41.85 
 
 
403 aa  280  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  37.91 
 
 
394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1995  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  40.82 
 
 
403 aa  271  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4085  cystathionine beta-lyase  40.7 
 
 
397 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131173  normal  0.238155 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0648  Cystathionine gamma-synthase  40.66 
 
 
404 aa  268  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  38.04 
 
 
392 aa  258  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  36.15 
 
 
392 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  39.12 
 
 
392 aa  252  7e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  38.62 
 
 
393 aa  250  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  35.81 
 
 
399 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  37.78 
 
 
394 aa  250  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  38.15 
 
 
407 aa  249  5e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  35.88 
 
 
390 aa  245  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  38.66 
 
 
390 aa  243  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  39.69 
 
 
379 aa  242  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  37.13 
 
 
386 aa  241  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  38.11 
 
 
390 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  36.99 
 
 
385 aa  240  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  36.92 
 
 
378 aa  239  6.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2896  Cystathionine gamma-synthase  39.71 
 
 
402 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.063757  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  37.18 
 
 
377 aa  237  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  34.91 
 
 
401 aa  236  4e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  35.11 
 
 
393 aa  236  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  35.9 
 
 
392 aa  236  6e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  37.37 
 
 
396 aa  236  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  37.88 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  37.44 
 
 
399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  38.17 
 
 
387 aa  233  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  38.27 
 
 
394 aa  233  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  37.11 
 
 
390 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  37.37 
 
 
390 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  38 
 
 
394 aa  231  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  40.31 
 
 
372 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  36.5 
 
 
402 aa  230  4e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4640  Cystathionine gamma-lyase  36.14 
 
 
394 aa  230  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  37.18 
 
 
388 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  35.59 
 
 
398 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  36.99 
 
 
397 aa  229  7e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  35.9 
 
 
378 aa  229  7e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  36.6 
 
 
390 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  35.18 
 
 
386 aa  229  8e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  35.94 
 
 
389 aa  229  9e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  35.38 
 
 
398 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  36.79 
 
 
392 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0500  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.78 
 
 
393 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.960396  normal  0.966435 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  37.21 
 
 
391 aa  228  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1851  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.48 
 
 
404 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225194  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  35.38 
 
 
398 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.73 
 
 
396 aa  227  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  33.08 
 
 
397 aa  226  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  36.01 
 
 
397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  36.59 
 
 
393 aa  226  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  35.81 
 
 
423 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  35.18 
 
 
397 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  36.29 
 
 
413 aa  224  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  36.88 
 
 
397 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  35.81 
 
 
423 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0520598 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  34.43 
 
 
400 aa  225  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3697  cystathionine gamma-synthase  35.2 
 
 
405 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1055  cystathionine gamma-synthase  39.32 
 
 
380 aa  225  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0734  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  31.74 
 
 
429 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.12755  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.4 
 
 
393 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  36.79 
 
 
383 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  37.08 
 
 
392 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  36.88 
 
 
383 aa  224  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  35.68 
 
 
381 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  35.22 
 
 
392 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  38.11 
 
 
392 aa  222  7e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  36.62 
 
 
397 aa  223  7e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.03 
 
 
403 aa  222  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8009  Cystathionine gamma-lyase  41.61 
 
 
406 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  36.36 
 
 
397 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3758  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.05 
 
 
406 aa  222  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3160  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  34.67 
 
 
433 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  37.03 
 
 
408 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  35.4 
 
 
398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  35.99 
 
 
383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  36.48 
 
 
426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  36.48 
 
 
376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09046  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  34.61 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.312528  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  35.48 
 
 
383 aa  220  3e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  36.36 
 
 
397 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  35.52 
 
 
386 aa  220  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  35.14 
 
 
380 aa  220  3.9999999999999997e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  36.59 
 
 
393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  36.36 
 
 
397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  37.5 
 
 
382 aa  219  5e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1093  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.94 
 
 
404 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.560821 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  33.84 
 
 
403 aa  219  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1656  O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase  33.73 
 
 
437 aa  219  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  34.1 
 
 
401 aa  219  6e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  36.18 
 
 
392 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2986  cystathionine beta-lyase  34.86 
 
 
387 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  35.25 
 
 
392 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  35.55 
 
 
391 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  34.52 
 
 
379 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  36.15 
 
 
397 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>