148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1068 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  96.69 
 
 		 393 aa  775    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 393 aa  795    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  65.38 
 
 		 399 aa  527  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  53.61 
 
 		 390 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  49.87 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  49.61 
 
 		 402 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  48.01 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1757  permease YjgP/YjgQ  46.04 
 
 		 416 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00499873  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  38.1 
 
 		 396 aa  295  1e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  32.63 
 
 		 389 aa  202  9e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  32.23 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  32.23 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  32.24 
 
 		 388 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  34.31 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  34.31 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0556  permease YjgP/YjgQ family protein  31.96 
 
 		 386 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  34.36 
 
 		 390 aa  178  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  30.28 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  30.6 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  31.63 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  31.64 
 
 		 388 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2838  permease YjgP/YjgQ family protein  27.65 
 
 		 405 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  29.07 
 
 		 388 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  28.93 
 
 		 388 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1190  permease YjgP/YjgQ family protein  25.68 
 
 		 380 aa  101  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504268  normal  0.434542 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  30.07 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  26.82 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  27.98 
 
 		 392 aa  90.1  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  25.96 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  22.33 
 
 		 389 aa  86.3  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  24.82 
 
 		 378 aa  86.3  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  23.28 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  22.04 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  26.34 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  22.65 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  23.19 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  23.6 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  22.19 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  23.33 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  23.25 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  24.76 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  23.08 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  23.33 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  22.47 
 
 		 371 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  22.47 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  22.15 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3065  permease YjgP/YjgQ family protein  25.83 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2421 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  23.46 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  23.28 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  22.67 
 
 		 379 aa  67  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  24.2 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  22.95 
 
 		 495 aa  65.1  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  24.62 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0995  permease YjgP/YjgQ  26.72 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  22.19 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  23.26 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  20.59 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  24.11 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  24.92 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  28.24 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  24.35 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  24.35 
 
 		 383 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  22.5 
 
 		 792 aa  57  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  24 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  24.76 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  23.99 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  23.99 
 
 		 371 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  22.6 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3417  permease YjgP/YjgQ family protein  23.36 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  21.07 
 
 		 1061 aa  55.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  25.88 
 
 		 365 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  21.07 
 
 		 1061 aa  54.7  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  23 
 
 		 388 aa  54.3  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0685  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 337 aa  54.3  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000242264  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  23.33 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  21.5 
 
 		 371 aa  53.9  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  18.84 
 
 		 386 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  23.19 
 
 		 366 aa  53.5  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3447  YjgP/YjgQ permease  26.42 
 
 		 356 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  24.51 
 
 		 370 aa  53.1  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0366  permease YjgP/YjgQ family protein  20.17 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000710908  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  22.05 
 
 		 441 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0593  permease-like protein  23.38 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.472296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  22.31 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  23.11 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  22.53 
 
 		 501 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02856  conserved hypothetical protein  25.79 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000121999  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3160  YjgP/YjgQ permease  25.79 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0713  permease YjgP/YjgQ family protein  25.79 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3265  YjgP/YjgQ permease  25.79 
 
 		 356 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.342085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02805  hypothetical protein  25.79 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000010354  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  22.82 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3905  permease YjgP/YjgQ family protein  21.68 
 
 		 400 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179565  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  22.28 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  29.51 
 
 		 357 aa  50.1  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  21.07 
 
 		 370 aa  49.7  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  20.52 
 
 		 483 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  21.95 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  22.33 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>