More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5321 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  100 
 
 
561 aa  1139    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  68.91 
 
 
551 aa  736    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  53.77 
 
 
564 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  53.46 
 
 
570 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  52.33 
 
 
577 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  52.71 
 
 
581 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  50.73 
 
 
583 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  50.91 
 
 
588 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  47.45 
 
 
572 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  45.65 
 
 
557 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  47.22 
 
 
586 aa  409  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  43.97 
 
 
578 aa  388  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  41.78 
 
 
553 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  41.78 
 
 
553 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  41.67 
 
 
559 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  42.08 
 
 
553 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  41.67 
 
 
559 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  40.72 
 
 
558 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  41.06 
 
 
558 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  40.72 
 
 
555 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  39.85 
 
 
579 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  40.45 
 
 
553 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  40.45 
 
 
553 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  40.45 
 
 
553 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  39.23 
 
 
535 aa  368  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  40.26 
 
 
553 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  40.26 
 
 
553 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  40.53 
 
 
555 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  38.97 
 
 
545 aa  368  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  40.45 
 
 
553 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  40.26 
 
 
553 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  39.55 
 
 
584 aa  365  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  40.61 
 
 
553 aa  364  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  39.25 
 
 
570 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  41.78 
 
 
563 aa  363  6e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  39.47 
 
 
555 aa  361  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  38.93 
 
 
569 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  38.05 
 
 
569 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  40.19 
 
 
550 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  39.14 
 
 
563 aa  348  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  38.83 
 
 
545 aa  346  7e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  38.68 
 
 
541 aa  342  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  37.66 
 
 
554 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  38.57 
 
 
578 aa  330  5.0000000000000004e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  39.02 
 
 
540 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  38.9 
 
 
524 aa  324  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  36.54 
 
 
535 aa  317  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  38.17 
 
 
544 aa  309  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  38.81 
 
 
540 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  36.33 
 
 
541 aa  303  5.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  36.49 
 
 
546 aa  303  6.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  38.05 
 
 
535 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  37.96 
 
 
535 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  34.47 
 
 
550 aa  268  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  38.1 
 
 
550 aa  266  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  34.06 
 
 
594 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.59 
 
 
554 aa  252  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  32.69 
 
 
585 aa  246  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  34.42 
 
 
547 aa  243  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  33.01 
 
 
525 aa  204  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0653  monooxygenase, FAD-binding  35.92 
 
 
484 aa  194  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  33.26 
 
 
504 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.7 
 
 
605 aa  179  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  29.68 
 
 
533 aa  169  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  30.2 
 
 
546 aa  167  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.71 
 
 
555 aa  160  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.43 
 
 
580 aa  158  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  34.62 
 
 
489 aa  158  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  30.26 
 
 
537 aa  158  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  30.31 
 
 
547 aa  156  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.42 
 
 
543 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  29.77 
 
 
553 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.79 
 
 
552 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  26.62 
 
 
531 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.95 
 
 
573 aa  148  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.95 
 
 
573 aa  148  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.95 
 
 
568 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  30.65 
 
 
414 aa  147  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  28.44 
 
 
565 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.55 
 
 
554 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.55 
 
 
554 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.55 
 
 
554 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  30.64 
 
 
501 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.57 
 
 
569 aa  146  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.03 
 
 
569 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  28.01 
 
 
554 aa  144  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.7 
 
 
554 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  27.7 
 
 
554 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  30.11 
 
 
477 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  29.2 
 
 
570 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  29.2 
 
 
570 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.51 
 
 
554 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  33.7 
 
 
537 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.54 
 
 
554 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.6 
 
 
529 aa  140  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  28.55 
 
 
537 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0593  monooxygenase, FAD-binding  27.27 
 
 
520 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  29.07 
 
 
511 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  30.99 
 
 
506 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  28.37 
 
 
537 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>