More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4319 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  58.16 
 
 		 200 aa  229  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  58.56 
 
 		 204 aa  222  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  57.46 
 
 		 204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 222 aa  191  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 196 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  48.96 
 
 		 197 aa  180  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 201 aa  134  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 196 aa  125  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 196 aa  125  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  39.86 
 
 		 156 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 212 aa  118  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 218 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  37.77 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 193 aa  112  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 206 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2864  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 192 aa  104  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 		 195 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  33.51 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 193 aa  101  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0493  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 222 aa  99.4  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0117598 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 203 aa  99.4  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2973  regulatory protein, TetR  53.33 
 
 		 102 aa  99  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  34.5 
 
 		 203 aa  99.4  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2762  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 		 219 aa  99  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1578  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 203 aa  99  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4065  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 195 aa  98.6  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0620  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 194 aa  98.6  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25370  transcriptional regulator  36.18 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422708  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1395  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 196 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 205 aa  95.5  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 201 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 201 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2964  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 195 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0240167  normal  0.157932 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 193 aa  95.1  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 214 aa  94.7  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2227  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 209 aa  94.7  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1418  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 196 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2631  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3433  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 222 aa  92.8  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2545  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 194 aa  92.4  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1379  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 196 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3676  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508637  decreased coverage  0.00105541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 198 aa  92  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 207 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 207 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  92  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 191 aa  91.7  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 191 aa  91.7  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 191 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  31.94 
 
 		 195 aa  89.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_2729  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
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NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
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NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 190 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
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NC_013595  Sros_8807  putative transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 211 aa  89.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 200 aa  89  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 371 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 204 aa  88.6  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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