More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3501 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3501  Outer membrane efflux protein  100 
 
 		 489 aa  979    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3836  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmvC  78.42 
 
 		 445 aa  592  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1877  Outer membrane efflux protein  38.65 
 
 		 413 aa  210  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1176  Outer membrane efflux protein  35.06 
 
 		 429 aa  184  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0040  outer membrane efflux protein  35.27 
 
 		 471 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  30.05 
 
 		 479 aa  147  6e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  28.61 
 
 		 437 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  27.89 
 
 		 423 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  27.89 
 
 		 423 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  27.89 
 
 		 423 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  28.33 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  28.01 
 
 		 415 aa  92  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  26.17 
 
 		 428 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  26.92 
 
 		 418 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2171  outer membrane efflux protein  31.1 
 
 		 415 aa  90.9  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00952498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  28.26 
 
 		 465 aa  91.3  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  26.23 
 
 		 460 aa  90.9  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  29.53 
 
 		 438 aa  89.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  27.68 
 
 		 443 aa  89  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  25.83 
 
 		 418 aa  87.8  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  26.83 
 
 		 432 aa  86.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  27.16 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  29.46 
 
 		 437 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  29.23 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  28.67 
 
 		 440 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  25.49 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  26.21 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  29.86 
 
 		 458 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  29.25 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  29.25 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  28.39 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  25.57 
 
 		 471 aa  80.1  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  28.43 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  29.31 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  24.87 
 
 		 451 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  29.31 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  25.18 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  28.75 
 
 		 425 aa  76.3  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  29.84 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1551  outer membrane efflux protein  27.88 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  25 
 
 		 472 aa  74.7  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  29.4 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  29.4 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  29.4 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  29.4 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  29.4 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  29.4 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  26.35 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  29.79 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1111  Outer membrane efflux protein  26.72 
 
 		 492 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.33067  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.18 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  31 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  27.08 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  26.68 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4536  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.85 
 
 		 533 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  23.79 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2564  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.58 
 
 		 495 aa  67.4  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248386  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  28.87 
 
 		 499 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  26.99 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  26.98 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  24.16 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  28.52 
 
 		 498 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  26.88 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  26.42 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.99 
 
 		 495 aa  65.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  28.61 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0185  outer membrane efflux protein  29.77 
 
 		 485 aa  65.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  28.71 
 
 		 488 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  23.71 
 
 		 523 aa  65.1  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5135  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.03 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  24.81 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27.54 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  25.63 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  26.67 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  27.59 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0851  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.5 
 
 		 537 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238751  hitchhiker  0.00377502 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1261  outer membrane efflux protein  26.97 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4904  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.878997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  26.32 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  25.74 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.26 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  22.37 
 
 		 416 aa  62  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  28.13 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4765  outer membrane efflux protein  29.77 
 
 		 485 aa  61.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.55701 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  26.32 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3073  outer membrane efflux protein  26.49 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4684  outer membrane efflux protein  29.67 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.307779 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3607  outer membrane efflux protein  29.67 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.864513 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1768  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  27.09 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0017  outer membrane efflux protein  24.45 
 
 		 473 aa  60.5  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1293  outer membrane efflux protein  23.22 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.803504 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6754  outer membrane efflux protein  24.12 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  23.5 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  24.47 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  28.24 
 
 		 422 aa  59.7  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  25.75 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  24.63 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  23.2 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>