66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0649 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0649  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  470  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2793  hypothetical protein  76.07 
 
 		 229 aa  337  7e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.340358 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2671  protein of unknown function DUF541  65.97 
 
 		 233 aa  292  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2213  protein of unknown function DUF541  65.55 
 
 		 233 aa  290  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.903363 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0835  hypothetical protein  55 
 
 		 246 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0991  protein of unknown function DUF541  56.31 
 
 		 243 aa  228  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2376  hypothetical protein  53.42 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1643  hypothetical protein  53.64 
 
 		 245 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2331  hypothetical protein  53.64 
 
 		 245 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2955  hypothetical protein  53.64 
 
 		 245 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575937  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0830  hypothetical protein  52.51 
 
 		 245 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1024  hypothetical protein  53.64 
 
 		 245 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1031  hypothetical protein  53.64 
 
 		 245 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0680  hypothetical protein  53.64 
 
 		 245 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1183  hypothetical protein  53.64 
 
 		 245 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3631  hypothetical protein  54.85 
 
 		 243 aa  224  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5790  hypothetical protein  53.51 
 
 		 246 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1848  hypothetical protein  54.98 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2459  hypothetical protein  54.98 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2508  hypothetical protein  54.07 
 
 		 245 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2464  hypothetical protein  54.5 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2218  hypothetical protein  54.15 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2404  putative signal peptide protein  64.81 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1585  hypothetical protein  38.97 
 
 		 239 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0198328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2730  hypothetical protein  37.13 
 
 		 245 aa  138  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797514  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2545  hypothetical protein  36.65 
 
 		 241 aa  135  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2853  hypothetical protein  38.16 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2499  protein of unknown function DUF541  39.48 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1896  hypothetical protein  35.59 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0542835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2712  hypothetical protein  37.2 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0375751  normal  0.0258251 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0846  hypothetical protein  34.45 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3152  hypothetical protein  38.63 
 
 		 237 aa  128  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1575  hypothetical protein  35.58 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0818  hypothetical protein  33.01 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4292  hypothetical protein  32.85 
 
 		 238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12530  hypothetical protein  31.68 
 
 		 236 aa  118  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.026062  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5109  hypothetical protein  31.49 
 
 		 236 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58330  hypothetical protein  31.06 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2584  protein of unknown function DUF541  35.57 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0925  hypothetical protein  30.92 
 
 		 238 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0886  hypothetical protein  30.92 
 
 		 238 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0929  hypothetical protein  30.73 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4232  hypothetical protein  31.53 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4555  hypothetical protein  31.88 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.734774  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1644  hypothetical protein  30.19 
 
 		 241 aa  98.2  9e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25595 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1438  hypothetical protein  29.34 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0128713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0977  hypothetical protein  28.93 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21947  hitchhiker  0.000157604 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0312  hypothetical protein  27 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0938  protein of unknown function DUF541  26.96 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.442407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2407  hypothetical protein  57.58 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1666  cyclic nucleotide-binding protein  30.85 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2790  hypothetical protein  26.73 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0325  hypothetical protein  21.99 
 
 		 237 aa  62  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000791137  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2477  protein of unknown function DUF541  28.16 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3227  hypothetical protein  26.89 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2830  hypothetical protein  26.89 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.753635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1029  hypothetical protein  26.7 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1463  hypothetical protein  23.65 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000388338  hitchhiker  0.000639516 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  27.36 
 
 		 245 aa  48.5  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  29.93 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4493  protein of unknown function DUF541  23.5 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4429  protein of unknown function DUF541  23.5 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  30.08 
 
 		 251 aa  45.4  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2769  protein of unknown function DUF541  23.94 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  26.87 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  26.84 
 
 		 245 aa  42.4  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>