More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1593 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 248 aa  501  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  83.33 
 
 		 247 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  60.74 
 
 		 256 aa  275  5e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  61.37 
 
 		 233 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  51.42 
 
 		 249 aa  259  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  56.17 
 
 		 243 aa  249  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  53.19 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  55.91 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  52.03 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  52.89 
 
 		 269 aa  238  8e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  47.77 
 
 		 259 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  52.21 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  52.38 
 
 		 251 aa  236  3e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  55.11 
 
 		 244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  49.15 
 
 		 244 aa  230  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  51.09 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  55.46 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  52.67 
 
 		 244 aa  228  5e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  51.53 
 
 		 246 aa  228  9e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  50.66 
 
 		 249 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  47.33 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  46.56 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  46.28 
 
 		 262 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  47.76 
 
 		 266 aa  225  6e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 262 aa  224  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  46.3 
 
 		 306 aa  224  7e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  49.8 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  57.07 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  47.46 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  53.88 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  51.69 
 
 		 241 aa  222  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  47.33 
 
 		 244 aa  221  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  42.5 
 
 		 242 aa  221  8e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  51.93 
 
 		 245 aa  212  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  51.22 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  52.1 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  49.16 
 
 		 245 aa  208  7e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  49.8 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  46.27 
 
 		 273 aa  205  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  46.72 
 
 		 237 aa  205  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  49.02 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  46.06 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  54.13 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  54.13 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  47.39 
 
 		 237 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  47.39 
 
 		 237 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  47.39 
 
 		 237 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  42.86 
 
 		 248 aa  199  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  45.54 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  45.6 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  48.8 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  45.85 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  42.2 
 
 		 230 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  46.29 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  46.45 
 
 		 242 aa  175  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3228  silent information regulator protein Sir2  40.8 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120892  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  39.67 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  43.46 
 
 		 243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  47.41 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  41.74 
 
 		 242 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  40.76 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  40.87 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  45.12 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  40.83 
 
 		 276 aa  169  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  46.09 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  42.74 
 
 		 276 aa  169  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  39.92 
 
 		 254 aa  169  6e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  43.04 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  41.45 
 
 		 276 aa  165  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  39.3 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  41.63 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  41.08 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  40 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  44.71 
 
 		 243 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  40.17 
 
 		 243 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  39.75 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0790  silent information regulator protein Sir2  44.93 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  40.87 
 
 		 242 aa  162  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  41.5 
 
 		 259 aa  161  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  44.21 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  41.77 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  39.13 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  39.58 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  39.58 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  39.58 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  39.58 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  44.23 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  39.58 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  41.1 
 
 		 232 aa  159  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  36.84 
 
 		 243 aa  159  5e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0294  Silent information regulator protein Sir2  40.57 
 
 		 249 aa  158  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  39.75 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  42.39 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3213  NAD-dependent deacetylase  43.36 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  41.7 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3645  NAD-dependent deacetylase  42.44 
 
 		 243 aa  155  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  35.95 
 
 		 247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  42.42 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  43.5 
 
 		 254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  42.29 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>