285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0365 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4079  histidine ammonia-lyase  73.45 
 
 		 540 aa  759    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463044  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0365  histidine ammonia-lyase protein  100 
 
 		 528 aa  1067    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3690  Histidine ammonia-lyase  78.26 
 
 		 532 aa  826    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235909 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0933  histidine ammonia-lyase  73.3 
 
 		 531 aa  774    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0696  histidine ammonia-lyase  75.57 
 
 		 531 aa  786    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4767  Histidine ammonia-lyase  78.26 
 
 		 532 aa  826    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.461511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3058  Histidine ammonia-lyase  73.02 
 
 		 531 aa  773    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244437  normal  0.468867 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3604  histidine ammonia-lyase  73.26 
 
 		 540 aa  760    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0433  histidine ammonia-lyase  63.73 
 
 		 514 aa  619  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.421734  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5099  histidine ammonia-lyase  62.13 
 
 		 515 aa  609  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004070  putative histidine ammonia-lyase protein  59.76 
 
 		 517 aa  599  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3894  histidine ammonia-lyase  59.56 
 
 		 520 aa  597  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4602  histidine ammonia-lyase  58.76 
 
 		 520 aa  592  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0319  histidine ammonia-lyase  57.96 
 
 		 519 aa  592  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171339 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3385  histidine ammonia-lyase  60.16 
 
 		 518 aa  593  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2097  putative phenylalanine and histidine ammonia-lyase  57.85 
 
 		 511 aa  588  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3917  Histidine ammonia-lyase  62.3 
 
 		 516 aa  589  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0336  histidine ammonia-lyase  58.17 
 
 		 524 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4374  histidine ammonia-lyase, putative  58.61 
 
 		 521 aa  587  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0334  histidine ammonia-lyase  58.17 
 
 		 524 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3517  histidine ammonia-lyase  58.57 
 
 		 520 aa  586  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0344  histidine ammonia-lyase  58.03 
 
 		 521 aa  585  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3682  histidine ammonia-lyase  57.95 
 
 		 521 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0346  histidine ammonia-lyase  58.25 
 
 		 520 aa  587  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0344  Histidine ammonia-lyase  58.17 
 
 		 524 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0335  histidine ammonia-lyase  59.13 
 
 		 521 aa  587  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0341  histidine ammonia-lyase  58.17 
 
 		 524 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0440  histidine ammonia-lyase  58.25 
 
 		 524 aa  579  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1493  histidine ammonia-lyase  56.34 
 
 		 528 aa  537  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1004  histidine ammonia-lyase  55.56 
 
 		 511 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1739  histidine ammonia-lyase  44.25 
 
 		 540 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0504276  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2100  Histidine ammonia-lyase  39.21 
 
 		 506 aa  354  2e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.742881  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5061  Histidine ammonia-lyase  42.07 
 
 		 715 aa  343  4e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.14793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  37.11 
 
 		 511 aa  292  9e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  36.01 
 
 		 508 aa  282  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  35.19 
 
 		 516 aa  280  6e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  32.54 
 
 		 507 aa  279  9e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  37.65 
 
 		 535 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2124  histidine ammonia-lyase  33.95 
 
 		 513 aa  271  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  33.2 
 
 		 504 aa  270  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  33.2 
 
 		 504 aa  270  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  34.33 
 
 		 509 aa  266  5e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  37.24 
 
 		 516 aa  266  8e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  39.34 
 
 		 508 aa  263  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  34.2 
 
 		 489 aa  263  4e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1109  histidine ammonia-lyase  32.68 
 
 		 506 aa  261  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  32.27 
 
 		 508 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  38.14 
 
 		 507 aa  261  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  35.46 
 
 		 506 aa  260  5.0000000000000005e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1999  Histidine ammonia-lyase  32.02 
 
 		 509 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  33.53 
 
 		 511 aa  257  3e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  36.14 
 
 		 533 aa  257  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  35.88 
 
 		 504 aa  257  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  35.44 
 
 		 512 aa  257  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3574  histidine ammonia-lyase  35.76 
 
 		 523 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183418  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  37.53 
 
 		 526 aa  256  8e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  34.92 
 
 		 520 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3256  histidine ammonia-lyase  35.56 
 
 		 523 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  31.2 
 
 		 523 aa  254  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1047  Histidine ammonia-lyase  33.56 
 
 		 502 aa  253  5.000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  32.27 
 
 		 498 aa  252  1e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  37.27 
 
 		 518 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  34.81 
 
 		 510 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  35.28 
 
 		 510 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  32.35 
 
 		 507 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  32.33 
 
 		 509 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1853  Histidine ammonia-lyase  30.64 
 
 		 512 aa  251  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03915  histidine ammonia-lyase  30.1 
 
 		 511 aa  251  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.699156  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  33.6 
 
 		 510 aa  251  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  34.82 
 
 		 510 aa  249  7e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1820  histidine ammonia-lyase  34.77 
 
 		 530 aa  249  7e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175616  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  34.18 
 
 		 513 aa  249  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  34.18 
 
 		 513 aa  249  8e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  34.18 
 
 		 513 aa  249  8e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0175  histidine ammonia-lyase  34.59 
 
 		 567 aa  249  9e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3988  histidine ammonia-lyase  33.66 
 
 		 567 aa  249  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  36.44 
 
 		 514 aa  249  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  34.18 
 
 		 510 aa  249  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  33.79 
 
 		 513 aa  248  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1820  histidine ammonia-lyase  37.63 
 
 		 514 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  37.45 
 
 		 507 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1098  histidine ammonia-lyase  38.67 
 
 		 506 aa  248  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  35.32 
 
 		 519 aa  248  3e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  33.48 
 
 		 505 aa  247  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  34.57 
 
 		 511 aa  247  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  33.6 
 
 		 513 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  32.97 
 
 		 505 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  33.2 
 
 		 513 aa  246  6e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  38.36 
 
 		 507 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  32.97 
 
 		 505 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  32.97 
 
 		 505 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  32.81 
 
 		 514 aa  246  8e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  34.94 
 
 		 506 aa  246  9e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 		 505 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  37.42 
 
 		 529 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  33.4 
 
 		 513 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  33.56 
 
 		 505 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  33.4 
 
 		 513 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  33.4 
 
 		 513 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  37.42 
 
 		 533 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>