180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0927 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  100 
 
 		 297 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0816  ribonuclease BN  93.58 
 
 		 297 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.941783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5235  ribonuclease BN  85.52 
 
 		 297 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.192166  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4883  ribonuclease BN  83.16 
 
 		 297 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3484  ribonuclease BN  80.68 
 
 		 297 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  80.68 
 
 		 297 aa  463  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1137  ribonuclease BN-like family transmembrane protein  79.17 
 
 		 301 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3250  ribonuclease BN  58.33 
 
 		 302 aa  297  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0308  putative ribonuclease BN  56.25 
 
 		 300 aa  296  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686269  normal  0.0663425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0280  ribonuclease BN  57.3 
 
 		 288 aa  285  7e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4509  ribonuclease BN  52.21 
 
 		 293 aa  265  8e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581699  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4573  ribonuclease BN  49.45 
 
 		 293 aa  261  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101037  hitchhiker  0.00311377 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1004  putative ribonuclease BN  46.46 
 
 		 288 aa  246  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4347  ribonuclease BN  51.97 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2188  ribonuclease BN  50.54 
 
 		 317 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.811945  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1978  ribonuclease BN, putative  45.45 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1903  YihY family protein  45.45 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2506  ribonuclease BN  51.07 
 
 		 315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000575853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2230  ribonuclease BN  51.07 
 
 		 315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.956243  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2527  putative ribonuclease BN  45.71 
 
 		 290 aa  227  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.322273 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3028  putative ribonuclease BN  46.93 
 
 		 283 aa  225  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2377  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3556  ribonuclease BN  46.57 
 
 		 307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176466  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3849  ribonuclease BN  45.85 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4005  ribonuclease transmembrane protein  45.68 
 
 		 298 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0051  YihY family protein  39.35 
 
 		 285 aa  179  4e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1180  ribonuclease BN, putative  37.36 
 
 		 288 aa  133  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.012264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  36.76 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  36.4 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  33.59 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  31.49 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  34.32 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  28.97 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  28.37 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  28.37 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  28.37 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  28.37 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  28.37 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  28.37 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  28.37 
 
 		 289 aa  102  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  27.55 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  27 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  36.27 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  26.92 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  34.89 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  27.68 
 
 		 286 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  27.9 
 
 		 288 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  27.9 
 
 		 288 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  28.9 
 
 		 377 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  29.23 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1292  ribonuclease BN family protein  27.89 
 
 		 271 aa  90.1  4e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  34.27 
 
 		 319 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  34.27 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  34.27 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  28.78 
 
 		 316 aa  86.7  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  28.08 
 
 		 277 aa  86.3  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  27.96 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  30.22 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  30.36 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  30.36 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  30.36 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  26.83 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  28.46 
 
 		 363 aa  82.4  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  27.24 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  26.67 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0656  ribonuclease BN  28.68 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.173698 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  27.61 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  32.86 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  32.02 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  28.67 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  24.73 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  25.45 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1937  putative ribonuclease BN  30.36 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.666523  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1971  putative ribonuclease BN  30.36 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.493707  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  31.2 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  26.07 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  26.57 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  27.44 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  28.44 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  28.36 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  25.67 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3487  putative ribonuclease BN  23.41 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5922  ribonuclease BN  25.27 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  0.574915 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3592  ribonuclease BN  28.63 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  27.52 
 
 		 351 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  28.68 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  30.11 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  21.67 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08426  Ribonuclease BN  25.47 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.724596  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4768  ribonuclease BN  28.19 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211591  normal  0.0891393 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  28.47 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0050  ribonuclease BN  27.11 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  25.27 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  27.06 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  25.1 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0395  YihY family protein  22.97 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  27.21 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  31.25 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  29.26 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  27.48 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2034  ribonuclease BN  24.33 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>