153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2587 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  100 
 
 		 619 aa  1285    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  69.67 
 
 		 618 aa  871    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  40.72 
 
 		 592 aa  432  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  40.72 
 
 		 592 aa  432  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  36.15 
 
 		 612 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  36.15 
 
 		 612 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  36.06 
 
 		 610 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  35.89 
 
 		 610 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  36.06 
 
 		 610 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  36.06 
 
 		 612 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  36.06 
 
 		 610 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  37.93 
 
 		 1148 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  39.15 
 
 		 589 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  38.53 
 
 		 617 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  34.71 
 
 		 613 aa  375  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  38.88 
 
 		 1153 aa  362  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  36.15 
 
 		 562 aa  316  6e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  35.94 
 
 		 998 aa  299  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  35.76 
 
 		 998 aa  297  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  32.65 
 
 		 577 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  34.62 
 
 		 991 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  33.11 
 
 		 577 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  32.26 
 
 		 615 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  31.03 
 
 		 631 aa  256  6e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  30.67 
 
 		 629 aa  250  5e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  30.67 
 
 		 631 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  28.67 
 
 		 813 aa  246  9e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  28.24 
 
 		 615 aa  239  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  33.18 
 
 		 625 aa  238  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  30.29 
 
 		 601 aa  237  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  31.53 
 
 		 639 aa  234  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  29.44 
 
 		 601 aa  232  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  31.7 
 
 		 635 aa  229  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  29.68 
 
 		 621 aa  223  8e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  30.56 
 
 		 594 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  30.07 
 
 		 614 aa  220  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  27.79 
 
 		 642 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  30.07 
 
 		 614 aa  219  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  27.79 
 
 		 642 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  27.97 
 
 		 642 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  27.79 
 
 		 642 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  27.79 
 
 		 642 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  30.62 
 
 		 615 aa  217  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  29.51 
 
 		 613 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  28.21 
 
 		 614 aa  216  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  28.74 
 
 		 597 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  30.74 
 
 		 842 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  29.94 
 
 		 599 aa  211  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  27.81 
 
 		 608 aa  208  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  28.48 
 
 		 596 aa  207  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  28.67 
 
 		 621 aa  207  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  25.8 
 
 		 604 aa  206  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  28.32 
 
 		 596 aa  203  7e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  29.58 
 
 		 577 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  25.62 
 
 		 604 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  29.68 
 
 		 582 aa  200  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  28.09 
 
 		 607 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  29.25 
 
 		 819 aa  194  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  29.56 
 
 		 582 aa  192  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  29.56 
 
 		 582 aa  192  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  29.56 
 
 		 582 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  28.75 
 
 		 580 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  28.6 
 
 		 580 aa  189  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  27.88 
 
 		 572 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  29.23 
 
 		 602 aa  172  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  25.21 
 
 		 578 aa  171  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  29.06 
 
 		 616 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  29.2 
 
 		 799 aa  154  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4058  IucA/IucC  29.59 
 
 		 716 aa  131  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.309342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  26.59 
 
 		 633 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  29.83 
 
 		 563 aa  115  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  25.07 
 
 		 653 aa  105  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  29.15 
 
 		 655 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  28.57 
 
 		 655 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  24.58 
 
 		 656 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  24.58 
 
 		 656 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  25.55 
 
 		 637 aa  99  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  23.24 
 
 		 610 aa  98.2  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  26.26 
 
 		 610 aa  94  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  27.46 
 
 		 584 aa  91.3  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  25.27 
 
 		 588 aa  87  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2672  IucA/IucC family protein  26.07 
 
 		 637 aa  85.9  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  25.65 
 
 		 613 aa  84.3  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  24.7 
 
 		 611 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  24.65 
 
 		 580 aa  82.8  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  25.69 
 
 		 645 aa  82  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  25.45 
 
 		 578 aa  80.9  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  24.15 
 
 		 591 aa  80.1  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  24.36 
 
 		 580 aa  80.1  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  25.88 
 
 		 606 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  23.49 
 
 		 575 aa  77.8  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2846  FrgA protein  23.92 
 
 		 575 aa  77.4  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  25.52 
 
 		 608 aa  77.4  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2589  IucA/IucC  25.38 
 
 		 627 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521559  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6950  IucA/IucC family protein  27.74 
 
 		 587 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  24.93 
 
 		 584 aa  75.5  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  24.93 
 
 		 584 aa  75.5  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  23.97 
 
 		 585 aa  72.8  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  23.97 
 
 		 585 aa  72.8  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  22.67 
 
 		 602 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>