291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2173 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 346 aa  714    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  65.7 
 
 		 341 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  37.57 
 
 		 327 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  33.94 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  32.95 
 
 		 323 aa  176  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  32.66 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  35.82 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  32.32 
 
 		 316 aa  155  7e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  33.87 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  33.87 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  33.05 
 
 		 326 aa  143  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  32.7 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  33.87 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  33.87 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  31.99 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  33.44 
 
 		 325 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  33.88 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  32.59 
 
 		 325 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  33.02 
 
 		 325 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  32.57 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  32.05 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  29.57 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  27.7 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  27.64 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  29.76 
 
 		 316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  32.34 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  30.11 
 
 		 333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.62 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.25 
 
 		 296 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  30.4 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  28.48 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  29.7 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1765  ornithine cyclodeaminase/Mu-crystallin family protein  31.8 
 
 		 466 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340839 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.92 
 
 		 312 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798228  normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  30.21 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  29.03 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.92 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  30.94 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  32.22 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3343  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.37 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0515229 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  30 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  29.34 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  27.87 
 
 		 323 aa  110  5e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  27.94 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  33.98 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2747  ornithine cyclodeaminase  28.66 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908103  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  28.1 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4907  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.9 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.859869  normal  0.025837 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  33.86 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  27.38 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.37 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3400  ornithine cyclodeaminase  31.54 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  31.21 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  27.22 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  28.44 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  33.84 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  29.35 
 
 		 318 aa  102  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  30.42 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  30.11 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  30.87 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.66 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  30.56 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  28.14 
 
 		 324 aa  100  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  28.4 
 
 		 297 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.8 
 
 		 348 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  26.09 
 
 		 331 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  29.74 
 
 		 303 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  27.17 
 
 		 329 aa  99  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  29.18 
 
 		 318 aa  97.8  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  28.36 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  27.52 
 
 		 326 aa  97.1  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  28 
 
 		 323 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  26.74 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3381  ornithine cyclodeaminase  29.39 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  29.55 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1291  ornithine cyclodeaminase  31.56 
 
 		 317 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2543  ornithine cyclodeaminase  31.56 
 
 		 370 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0739347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1371  ornithine cyclodeaminase  31.56 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  29.08 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_003296  RS00875  ornithine cyclodeaminase protein  28.37 
 
 		 340 aa  93.6  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0180159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1457  ornithine cyclodeaminase  29.93 
 
 		 323 aa  93.2  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  26.32 
 
 		 329 aa  93.6  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  28.41 
 
 		 303 aa  93.2  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003670  ornithine cyclodeaminase  28.27 
 
 		 324 aa  93.2  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  28.69 
 
 		 323 aa  92.8  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1290  ornithine cyclodeaminase  29.47 
 
 		 315 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1031  ornithine cyclodeaminase  29.47 
 
 		 315 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0266  ornithine cyclodeaminase  29.47 
 
 		 315 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0536  ornithine cyclodeaminase  29.47 
 
 		 315 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  31.98 
 
 		 305 aa  92.4  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  27.64 
 
 		 314 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3527  ornithine cyclodeaminase  28.14 
 
 		 322 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  30.68 
 
 		 317 aa  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  30.62 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5997  ornithine cyclodeaminase  31.27 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  28.52 
 
 		 313 aa  90.9  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  29.82 
 
 		 338 aa  90.5  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2610  ornithine cyclodeaminase  28.31 
 
 		 317 aa  90.5  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.329826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  27.46 
 
 		 359 aa  89.7  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34775  predicted protein  25.68 
 
 		 346 aa  89.4  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>