80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1726 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  515  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  59.55 
 
 		 240 aa  268  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  35.84 
 
 		 220 aa  123  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2238  hypothetical protein  37.96 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  34.72 
 
 		 393 aa  112  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3129  PGAP1 family protein  37.21 
 
 		 210 aa  106  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  31.6 
 
 		 254 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0515  hypothetical protein  34.26 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000571  cob(I)alamin adenosyltransferase  31.48 
 
 		 205 aa  95.1  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  30.7 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0546  acetyltransferase/hydrolase  31.82 
 
 		 216 aa  93.6  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338996  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  31.3 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  29.49 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  30.09 
 
 		 205 aa  88.6  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  31.73 
 
 		 210 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  28.83 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  28.27 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  28.44 
 
 		 254 aa  85.9  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  30.52 
 
 		 309 aa  85.5  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  30.59 
 
 		 216 aa  85.1  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3354  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  29.41 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2914  putative alpha/beta hydrolase  30.67 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274125  normal  0.502699 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1019  hypothetical protein  27.44 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  29.17 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  29.33 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01554  hypothetical protein  28.3 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.114311  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  28.57 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  30.56 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  29.55 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  21.43 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2277  hypothetical protein  27.88 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  27.52 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  36.13 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1406  Lecithin:cholesterol acyltransferase  25.56 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  30.25 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2648  hypothetical protein  23.58 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.549613  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0345  hypothetical protein  24.22 
 
 		 325 aa  58.9  0.00000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  36.36 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  27.1 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  30.93 
 
 		 361 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  30.17 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  35.34 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  26.07 
 
 		 294 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  27.69 
 
 		 304 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  35.65 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  32.71 
 
 		 313 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  24.19 
 
 		 302 aa  50.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  32.74 
 
 		 286 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  28.44 
 
 		 203 aa  48.5  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2600  PGAP1 family protein  34.67 
 
 		 589 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2455  lipase, putative  19.82 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1109  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00126644  hitchhiker  0.00394602 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  23.7 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  23.7 
 
 		 303 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0134  PGAP1 family protein  25.25 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.535724  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  28.57 
 
 		 338 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  29.15 
 
 		 282 aa  46.6  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  25.83 
 
 		 200 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  25.83 
 
 		 200 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  31.73 
 
 		 191 aa  45.8  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  29.46 
 
 		 338 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  29.63 
 
 		 324 aa  45.4  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.21 
 
 		 286 aa  45.4  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  29.25 
 
 		 195 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  27.68 
 
 		 281 aa  45.4  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  29.25 
 
 		 195 aa  45.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  27.71 
 
 		 299 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2778  hypothetical protein  28.03 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  27.27 
 
 		 332 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  27.68 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  28.83 
 
 		 342 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  27.03 
 
 		 382 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  28.57 
 
 		 276 aa  42.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  28.99 
 
 		 430 aa  42.4  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  29.52 
 
 		 339 aa  42  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1128  hypothetical protein  22.7 
 
 		 303 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361398  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  25.58 
 
 		 332 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  23.68 
 
 		 216 aa  42  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3950  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 474 aa  42  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  27.93 
 
 		 281 aa  42  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>