More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1000 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 285 aa  588  1e-167  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  66.67 
 
 		 278 aa  394  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  64.96 
 
 		 322 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  56.38 
 
 		 285 aa  331  9e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  54.18 
 
 		 286 aa  315  4e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  53.24 
 
 		 287 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  52.73 
 
 		 282 aa  306  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  50.18 
 
 		 287 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  50.53 
 
 		 287 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  45.55 
 
 		 286 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  48.55 
 
 		 289 aa  254  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  45.62 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  41.3 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  39.78 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  40.36 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4123  alpha/beta hydrolase fold  40.29 
 
 		 298 aa  215  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0550  alpha/beta family hydrolase  39.93 
 
 		 298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.628358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5218  alpha/beta hydrolase fold protein  37.81 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4734  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 		 285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2213  alpha/beta hydrolase fold protein  36.27 
 
 		 280 aa  199  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302063 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0267  alpha/beta family hydrolase  37.94 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6652  alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0311  alpha/beta hydrolase  36.21 
 
 		 281 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4538  alpha/beta hydrolase fold protein  37.24 
 
 		 284 aa  192  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  hitchhiker  0.00753494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2018  alpha/beta hydrolase fold  39.65 
 
 		 279 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.800394 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5070  alpha/beta hydrolase fold  33.99 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3161  alpha/beta hydrolase fold  33.99 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5207  alpha/beta hydrolase fold  33.99 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  31.52 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  28 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5181  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.941772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 		 286 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.42 
 
 		 262 aa  92  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  26.46 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 		 264 aa  89.7  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.01 
 
 		 265 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28.2 
 
 		 265 aa  89  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.99 
 
 		 268 aa  89  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  24.01 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 275 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  25.38 
 
 		 316 aa  85.5  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 284 aa  85.5  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  24.83 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  26.88 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  26.37 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  24.5 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0431  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0538885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  24.5 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.58 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.5 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  25.17 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0559  hypothetical protein  32.52 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.881778  normal  0.0430295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0744  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0750  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0913521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0764  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  26.96 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  25.17 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  24.83 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  24.83 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  23.33 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  24.23 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  25.65 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  27.75 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4596  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  hitchhiker  0.00401352 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0069  alpha/beta hydrolase fold  27.75 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  24.49 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  24.42 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  24.42 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0251  alpha/beta hydrolase fold protein  23.57 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  24.54 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  27.34 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  23.83 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  25.26 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  26.2 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>