More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0767 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  897    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  78.84 
 
 
433 aa  727    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  78.6 
 
 
433 aa  723    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  44.44 
 
 
434 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  29.86 
 
 
466 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  29.73 
 
 
469 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  29.46 
 
 
475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  28.21 
 
 
457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  28.15 
 
 
451 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  28.15 
 
 
451 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  29.12 
 
 
440 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  27.19 
 
 
432 aa  172  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  29.95 
 
 
473 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  30.82 
 
 
445 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  27.23 
 
 
454 aa  170  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  34.83 
 
 
574 aa  169  9e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  27.38 
 
 
452 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  30.65 
 
 
448 aa  166  9e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  26.68 
 
 
464 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  27.25 
 
 
440 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  32.22 
 
 
437 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  34.43 
 
 
543 aa  163  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  33.44 
 
 
438 aa  162  9e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  32.18 
 
 
443 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  34.23 
 
 
440 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  32.65 
 
 
457 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  29.07 
 
 
629 aa  160  5e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  28.64 
 
 
461 aa  160  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  32.24 
 
 
454 aa  159  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  32.01 
 
 
452 aa  159  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  30.94 
 
 
476 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  29.35 
 
 
448 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  33.33 
 
 
445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  32.17 
 
 
436 aa  156  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  33.33 
 
 
445 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  33.33 
 
 
445 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  27.55 
 
 
446 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  33.44 
 
 
445 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  33.54 
 
 
473 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  33.67 
 
 
445 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  32.11 
 
 
458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  32.68 
 
 
438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  29.73 
 
 
470 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  35.48 
 
 
558 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  32.36 
 
 
455 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  32.57 
 
 
455 aa  152  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  34 
 
 
447 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1420  hypothetical protein  32.66 
 
 
486 aa  149  7e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  31.82 
 
 
451 aa  149  7e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  28.57 
 
 
483 aa  149  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  32.23 
 
 
448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  32.77 
 
 
447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  29.97 
 
 
462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  29.29 
 
 
441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1468  hypothetical protein  29.84 
 
 
562 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.954776  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  33.78 
 
 
561 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  31.73 
 
 
477 aa  146  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  36.11 
 
 
556 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.38 
 
 
558 aa  145  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  34.22 
 
 
562 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  33.78 
 
 
584 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  31.94 
 
 
561 aa  144  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  36.48 
 
 
552 aa  143  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1402  hypothetical protein  25.88 
 
 
495 aa  143  6e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  27.49 
 
 
454 aa  143  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  30.89 
 
 
485 aa  142  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  31.33 
 
 
499 aa  142  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80246  mitochondrial chaperone  29.19 
 
 
560 aa  141  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.763396  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  28.67 
 
 
438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  32.17 
 
 
558 aa  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1060  ABC transporter  26.51 
 
 
495 aa  141  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  33.22 
 
 
578 aa  141  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  27.33 
 
 
455 aa  140  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  31.83 
 
 
556 aa  139  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  31.01 
 
 
454 aa  138  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  33.2 
 
 
455 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  32.68 
 
 
470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3756  ABC-1 domain protein  32.88 
 
 
563 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  28.43 
 
 
453 aa  137  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  28.77 
 
 
440 aa  136  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  26.03 
 
 
440 aa  136  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  32.39 
 
 
453 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  31.77 
 
 
585 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  30.91 
 
 
558 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  31.06 
 
 
468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  26.42 
 
 
440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  32.14 
 
 
563 aa  134  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  32.24 
 
 
565 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  32.24 
 
 
565 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  31.58 
 
 
453 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  30.77 
 
 
619 aa  132  9e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  30.72 
 
 
767 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  34.8 
 
 
557 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.25 
 
 
549 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.36 
 
 
555 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4857  ABC-1 domain protein  34.07 
 
 
646 aa  131  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.982247 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.07 
 
 
573 aa  131  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1003  hypothetical protein  34.6 
 
 
580 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  28.19 
 
 
440 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  32.12 
 
 
571 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>