More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0719 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0719  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
197 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179161 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1355  resolvase-like protein  93.09 
 
 
190 aa  356  9.999999999999999e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2477  resolvase-like protein  88.66 
 
 
198 aa  348  2e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131622  normal  0.782919 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  48.24 
 
 
206 aa  171  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  42.16 
 
 
220 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  46.89 
 
 
205 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  44.72 
 
 
208 aa  142  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  40 
 
 
209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  40 
 
 
211 aa  137  7.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  39.6 
 
 
207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  41.09 
 
 
206 aa  134  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  41.09 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  40.78 
 
 
231 aa  131  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  39.71 
 
 
228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  38.92 
 
 
213 aa  128  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  38.92 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  38.12 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  37.02 
 
 
214 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  39.13 
 
 
210 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  37.81 
 
 
207 aa  122  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  41.28 
 
 
205 aa  122  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  38.61 
 
 
206 aa  121  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  42.07 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  40.8 
 
 
208 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  35.35 
 
 
222 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  35.64 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  40.34 
 
 
209 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  39.77 
 
 
212 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  39.3 
 
 
205 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  39.44 
 
 
208 aa  115  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  40.34 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  37.13 
 
 
204 aa  114  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  36.32 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  39.77 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  39.77 
 
 
209 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  37.81 
 
 
210 aa  112  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  36 
 
 
202 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  36 
 
 
202 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  36 
 
 
202 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  35.35 
 
 
283 aa  92.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  31.82 
 
 
301 aa  84  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  30.65 
 
 
245 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  30.15 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  31.94 
 
 
205 aa  72  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  25.77 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  30.41 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  30.41 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  30.41 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  28.87 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  30.15 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  28.8 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  29.65 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  28.28 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  28.79 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  28.12 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  29.84 
 
 
179 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  30.73 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  29.15 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  29.59 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  31.25 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  31.28 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  27.98 
 
 
186 aa  64.3  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  27.69 
 
 
189 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  29.44 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  30.26 
 
 
194 aa  63.2  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1397  Resolvase domain protein  29.9 
 
 
209 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  27.46 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  27.08 
 
 
318 aa  62.4  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  31 
 
 
188 aa  62  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  30.15 
 
 
190 aa  62  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  26.9 
 
 
201 aa  61.6  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  32.95 
 
 
462 aa  61.6  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  29.95 
 
 
235 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  29.23 
 
 
181 aa  61.6  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  30.43 
 
 
203 aa  61.6  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  31.25 
 
 
193 aa  61.2  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  28.65 
 
 
188 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  29.9 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  27.32 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  27.86 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  28.35 
 
 
194 aa  60.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  28.28 
 
 
185 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2479  hypothetical protein  33.67 
 
 
138 aa  59.3  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.802993 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  29.95 
 
 
185 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  28.87 
 
 
188 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  28.95 
 
 
179 aa  59.3  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  28.64 
 
 
198 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  30.96 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  27.37 
 
 
199 aa  59.3  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  26.5 
 
 
184 aa  58.9  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  26.67 
 
 
184 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  26.15 
 
 
184 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  27.72 
 
 
192 aa  58.2  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.93 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3655  Resolvase domain protein  29.53 
 
 
212 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0554731  normal  0.301287 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  26.94 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  28.43 
 
 
186 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  26.94 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  28.86 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  29.38 
 
 
189 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>