62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3367 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  100 
 
 		 970 aa  1940    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  34.04 
 
 		 914 aa  336  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  30.92 
 
 		 1122 aa  320  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  30.79 
 
 		 908 aa  270  8e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1782  prophage tail length tape measure  46.27 
 
 		 1835 aa  226  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1628  prophage tail length tape measure  43.93 
 
 		 1906 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.937522  normal  0.73173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3255  prophage tail length tape measure  41.55 
 
 		 1555 aa  209  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0755523  decreased coverage  0.000000000000332378 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  34.62 
 
 		 957 aa  206  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  26.9 
 
 		 1063 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2235  prophage tail length tape measure  43.77 
 
 		 1113 aa  186  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  28.26 
 
 		 1161 aa  164  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1467  tail length tape measure protein  29.05 
 
 		 857 aa  157  8e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  31.29 
 
 		 1167 aa  152  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2768  putative prophage tail length tape measure protein  31.6 
 
 		 859 aa  147  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1633  putative prophage tail length tape measure protein  32.34 
 
 		 849 aa  147  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1195  putative prophage tail length tape measure protein  31.6 
 
 		 859 aa  147  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  27.41 
 
 		 1021 aa  146  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  32.34 
 
 		 853 aa  146  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  31.97 
 
 		 853 aa  144  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10049  tail component  31.97 
 
 		 853 aa  144  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1079  gifsy-1 prophage VmtH  34.2 
 
 		 1028 aa  140  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.497302  normal  0.0993737 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1416  gifsy-1 prophage VmtH  34.2 
 
 		 1028 aa  140  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.312107  hitchhiker  0.00396593 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1151  gifsy-1 prophage VmtH  33.33 
 
 		 1028 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0703  gifsy-1 prophage VmtH  34.8 
 
 		 1031 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  34.8 
 
 		 1031 aa  132  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.617877 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0885  minor tail protein H  28.62 
 
 		 870 aa  100  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1872  putative prophage tail length tape measure protein  27.83 
 
 		 881 aa  98.2  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179958 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3194  putative prophage tail length tape measure protein  27.83 
 
 		 881 aa  98.2  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2277  putative phage tail protein  32.9 
 
 		 342 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1517  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  36.59 
 
 		 924 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813512  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1638  putative tail component of prophage CP-933K  22.12 
 
 		 936 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663672  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0797  phage-related minor tail protein  24.03 
 
 		 1115 aa  70.5  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404131 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2477  hypothetical protein  57.14 
 
 		 732 aa  70.1  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1353 aa  69.3  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  28.08 
 
 		 1190 aa  68.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3126  putative prophage tail length tape measure protein  60 
 
 		 881 aa  68.9  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0141545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1796  putative prophage tail length tape measure protein  44.29 
 
 		 881 aa  68.9  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132418 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1180  Prophage tail length tape measure  28.57 
 
 		 1707 aa  68.2  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.537045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1884  hypothetical protein  66.07 
 
 		 811 aa  66.6  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.505665  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3992  hypothetical protein  48.81 
 
 		 738 aa  65.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2177  hypothetical protein  33.6 
 
 		 620 aa  65.9  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502286 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  43.82 
 
 		 783 aa  64.7  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  27.6 
 
 		 1222 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  23.54 
 
 		 1263 aa  60.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7153  prophage tail length tape measure  25.56 
 
 		 913 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1192 aa  57.8  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1716  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  44.29 
 
 		 924 aa  57.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.309525  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1203 aa  57  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  25 
 
 		 1032 aa  54.7  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  54.55 
 
 		 1380 aa  51.6  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1349  lambda family phage tail tape measure protein  24.02 
 
 		 853 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.179371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  58.54 
 
 		 1127 aa  49.7  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  54.55 
 
 		 1366 aa  48.9  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  54.55 
 
 		 1354 aa  48.9  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0994  phage tail tape measure protein, TP901 family  68.57 
 
 		 1173 aa  48.1  0.0009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0089  putative phage tail tape measure protein  35.29 
 
 		 1521 aa  47.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  23.91 
 
 		 1032 aa  46.2  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  24.94 
 
 		 1160 aa  46.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3420  hypothetical protein  50 
 
 		 883 aa  45.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2089  hypothetical protein  34.12 
 
 		 735 aa  45.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1311  hypothetical protein  34.12 
 
 		 735 aa  45.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1880  hypothetical protein  38.82 
 
 		 698 aa  45.1  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.384763 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>