103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_5194 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_5194  Tn7-like transposition protein B  100 
 
 		 723 aa  1495    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7026  Tn7-like transposition protein B  38.22 
 
 		 735 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.314697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5724  Tn7-like transposition protein B  35.29 
 
 		 723 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2802  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  34.05 
 
 		 721 aa  327  6e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3198  Tn5468, transposase protein B  34.05 
 
 		 721 aa  327  6e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.649302  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2326  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  31.45 
 
 		 743 aa  321  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721105 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1116  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  32.57 
 
 		 721 aa  320  5e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0221  Tn7-like transposition protein B  35.58 
 
 		 728 aa  318  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.26166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1202  Tn5468, transposase protein B  33.68 
 
 		 722 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3948  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain protein  31.16 
 
 		 690 aa  308  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3487  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  31.67 
 
 		 742 aa  307  5.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.054848  normal  0.0804563 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0183  Tn7-like transposition protein B  31.62 
 
 		 730 aa  299  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1873  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  35.94 
 
 		 447 aa  272  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.701975  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0175  Tn7-like transposition protein B  29.65 
 
 		 716 aa  271  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0246  Integrase catalytic region  29.13 
 
 		 717 aa  250  6e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.337678 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3827  transposon Tn7 transposition protein TnsB  30.45 
 
 		 696 aa  248  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111993 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2931  putative transposase  27.98 
 
 		 672 aa  242  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5458  Tn7-like transposase  34.47 
 
 		 725 aa  239  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.451472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6966  hypothetical protein  29.5 
 
 		 728 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3935  putative transposase  27.43 
 
 		 697 aa  231  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3946  integrase catalytic subunit  26.57 
 
 		 696 aa  231  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4326  hypothetical protein  30.35 
 
 		 536 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4359  integrase catalytic subunit  30.92 
 
 		 690 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1175  hypothetical protein  27.29 
 
 		 748 aa  153  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628248  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4971  hypothetical protein  28.24 
 
 		 806 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3108  transposon Tn7 transposition protein B  24.67 
 
 		 735 aa  122  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  24.86 
 
 		 618 aa  92.8  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  24.86 
 
 		 618 aa  92.8  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6942  hypothetical protein  28.39 
 
 		 724 aa  88.6  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  23.63 
 
 		 618 aa  86.3  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  26.55 
 
 		 554 aa  85.5  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  25.54 
 
 		 548 aa  84.7  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  23.87 
 
 		 552 aa  80.5  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  27.42 
 
 		 551 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  24.83 
 
 		 547 aa  79.7  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  29.02 
 
 		 677 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  29.02 
 
 		 652 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  29.02 
 
 		 652 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  29.02 
 
 		 652 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  24.94 
 
 		 558 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  24.94 
 
 		 558 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  26.56 
 
 		 649 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  23.1 
 
 		 560 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  25.42 
 
 		 644 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  23.82 
 
 		 561 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  23.31 
 
 		 509 aa  71.2  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  23.31 
 
 		 572 aa  71.2  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  23.31 
 
 		 562 aa  71.2  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  25.08 
 
 		 616 aa  70.9  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  28.02 
 
 		 636 aa  70.1  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  31.61 
 
 		 617 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  30.64 
 
 		 617 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  30.19 
 
 		 536 aa  67.4  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  30.05 
 
 		 721 aa  66.6  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  26.35 
 
 		 542 aa  67  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1875  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  30.27 
 
 		 258 aa  65.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  22.87 
 
 		 614 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  26.87 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  28.25 
 
 		 382 aa  63.5  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  29.41 
 
 		 651 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  24.84 
 
 		 541 aa  62.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  24.84 
 
 		 541 aa  62.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  24.84 
 
 		 541 aa  62.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  24.84 
 
 		 541 aa  62.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  28.49 
 
 		 626 aa  60.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  21.43 
 
 		 595 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  24.68 
 
 		 560 aa  58.9  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  23.63 
 
 		 556 aa  57.8  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  23.63 
 
 		 556 aa  57.8  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  23.63 
 
 		 556 aa  57.8  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  23.63 
 
 		 556 aa  57.8  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  21.63 
 
 		 625 aa  57.4  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  22.56 
 
 		 560 aa  55.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0256  hypothetical protein  22.55 
 
 		 750 aa  54.7  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  24.79 
 
 		 650 aa  54.7  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  21.32 
 
 		 547 aa  53.9  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  21.99 
 
 		 640 aa  53.5  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  21.69 
 
 		 611 aa  52.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5405  transposase, TnsB-related protein  22.98 
 
 		 670 aa  52  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.296253  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  20.7 
 
 		 581 aa  51.6  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  21.33 
 
 		 640 aa  51.2  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  21.33 
 
 		 640 aa  51.2  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  23.55 
 
 		 497 aa  50.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2136  transposase  31.82 
 
 		 322 aa  50.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  20 
 
 		 632 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  22.43 
 
 		 782 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  20 
 
 		 640 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5797  integrase catalytic subunit  30.14 
 
 		 245 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  24.81 
 
 		 663 aa  49.3  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  22.11 
 
 		 636 aa  49.3  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  22.85 
 
 		 733 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  26.01 
 
 		 626 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  28.95 
 
 		 900 aa  48.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  28.95 
 
 		 900 aa  48.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  22.41 
 
 		 555 aa  47.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3659  integrase catalytic subunit  22.67 
 
 		 785 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2993  Transposase-like Mu  22.8 
 
 		 677 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06222  hypothetical protein  34.12 
 
 		 300 aa  46.2  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  25.69 
 
 		 670 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  21.55 
 
 		 630 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>