More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3150 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3150  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  591  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.266522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2046  LysR family transcriptional regulator  80.87 
 
 		 307 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3695  LysR family transcriptional regulator  81.54 
 
 		 326 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0378  LysR family transcriptional regulator  69.7 
 
 		 298 aa  421  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5932  putative transcriptional regulator  66.89 
 
 		 302 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  66.55 
 
 		 302 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  33.66 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  33.96 
 
 		 314 aa  176  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  38.18 
 
 		 298 aa  175  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4889  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1767  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406374  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2994  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1231  LysR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 315 aa  172  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2042  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.557762  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3385  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.521059  normal  0.192926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0112  LysR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4643  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1755  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2520  putative transcriptional regulator  36.77 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 329 aa  169  5e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 329 aa  169  7e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01325  transcriptional regulator, LysR family protein  33.55 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.57 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2045  transcriptional regulator, LysR family  38.77 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 307 aa  166  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2635  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 297 aa  166  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1214  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.134847  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05202  transcription regulator protein  36.55 
 
 		 304 aa  165  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000103081  normal  0.0105317 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  34.47 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.79 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2459  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2235  LysR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.130762  decreased coverage  0.000140411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2802  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 305 aa  162  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35830  Regulatory protein, LysR-family  39.31 
 
 		 298 aa  162  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  36.48 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 301 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 320 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 320 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2999  transcriptional regulator, LysR family  35.27 
 
 		 333 aa  162  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.4449  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2857  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 298 aa  162  9e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 345 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4833  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2305  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0145  transcriptional regulator, LysR family  35.95 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0674  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6418  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6130  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3445  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000626744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3889  transcriptional regulator, LysR family  38.28 
 
 		 300 aa  159  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4016  transcriptional regulator, LysR family  36.4 
 
 		 297 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3902  transcriptional regulator, LysR family  36.4 
 
 		 297 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.981327 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4022  putative LysR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 298 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0289175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2165  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 310 aa  158  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0776573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3833  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2223  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3185  putative transcriptional regulator  37.46 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  34 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0158  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 342 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000138303  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0138  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 305 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3446  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 312 aa  157  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000932924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0260  LysR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 297 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.184545  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37140  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000373718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3757  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 297 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1192  LysR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 297 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3766  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 297 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.536746  normal  0.203175 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2167  LysR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 297 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1894  LysR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 297 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0904  LysR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 297 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427435  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4597  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 297 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1710  LysR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 297 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3131  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 308 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4479  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4165  transcriptional regulator  39.71 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1878  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0352  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5074  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3495  regulatory protein, LysR  32.69 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.268712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5495  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3026  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2333  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4964  LysR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 297 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5115  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337357  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1527  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2911  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.960464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>