283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1522 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1522  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 314 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.802422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  35.33 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  39.17 
 
 		 329 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  31.41 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  32.11 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  29.3 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  27.88 
 
 		 317 aa  113  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2388  anti-FecI sigma factor, FecR  32.04 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.514905 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  28.81 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  27.94 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  30.9 
 
 		 320 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  33.33 
 
 		 311 aa  102  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  32.44 
 
 		 327 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  31.18 
 
 		 330 aa  99  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  32.34 
 
 		 327 aa  99  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  27.51 
 
 		 330 aa  97.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  33.33 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  32.12 
 
 		 311 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  28.52 
 
 		 324 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  28.16 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  32.48 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  33.33 
 
 		 327 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  32.83 
 
 		 353 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  29.84 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  31.19 
 
 		 329 aa  90.9  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  32.72 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  28.2 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  26.16 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  33.82 
 
 		 317 aa  89.4  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  33.01 
 
 		 324 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  28.62 
 
 		 301 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  27.69 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  29.17 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  31.16 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  29.61 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  28.89 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  33.82 
 
 		 326 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  28.93 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  29.43 
 
 		 311 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  27.39 
 
 		 326 aa  86.3  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  28.47 
 
 		 320 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  29.89 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  31.27 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  28.71 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  30.33 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  32.64 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  29.96 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  28.22 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06170  putative transmembrane sensor  30.48 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.202236  normal  0.0195078 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4498  anti FecI sigma factor, regulatory protein iron uptake  30.3 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  normal  0.0499598 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3315  anti-FecI sigma factor, FecR  31.58 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0379  anti-FecI sigma factor, FecR  30.48 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45013  normal  0.45289 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  30 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  32.6 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  26.82 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  28.42 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  29.17 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  28.41 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  33.59 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0351  anti-FecI sigma factor, FecR  30.48 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.547847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02240  anti-sigma factor, FecR family  34.91 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3085  transmembrane sensor, putative  31.84 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  32.29 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  31.53 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04158  transmembrane signal transducer for ferric citrate transport  32.57 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3708  anti-FecI sigma factor, FecR  32.57 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04121  hypothetical protein  32.57 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0744  fec operon regulator FecR  32.57 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117429  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  30.24 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  27.97 
 
 		 348 aa  79  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4869  fec operon regulator FecR  32.57 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4851  anti-FecI sigma factor, FecR  29.92 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  28.13 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  28.46 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0859  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  29.05 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  29.33 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  29.1 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  32.52 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1733  FecR protein  30.34 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.204897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  27.6 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  32.58 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0377  anti-FecI sigma factor, FecR  30.48 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  31.84 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  31.06 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  29.82 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  27.4 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  30.73 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  31.66 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  28.06 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  29.8 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  28.9 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  31.6 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17700  anti-sigma factor, FecR family  28.05 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  29.13 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  29.43 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0746  anti-FecI sigma factor, FecR  30.62 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  28.89 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2396  putative FecR  26.81 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0170576  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  26.16 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>