More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1282 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  100 
 
 		 457 aa  917    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  57.51 
 
 		 455 aa  503  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1430  HI0933 family protein  60.35 
 
 		 452 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1122  hypothetical protein  58.37 
 
 		 443 aa  475  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138213  normal  0.379331 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1052  hypothetical protein  55.23 
 
 		 442 aa  450  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.843089  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1476  HI0933 family protein  50.82 
 
 		 413 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1209  HI0933 family protein  48.98 
 
 		 443 aa  377  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892484 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  38.02 
 
 		 412 aa  252  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 		 409 aa  249  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  37.41 
 
 		 408 aa  238  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  34.49 
 
 		 406 aa  238  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  36.88 
 
 		 415 aa  236  6e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  33.79 
 
 		 412 aa  234  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  34.41 
 
 		 420 aa  231  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.41 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.41 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  35.76 
 
 		 410 aa  231  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  34.12 
 
 		 414 aa  229  6e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  36.38 
 
 		 433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  37.3 
 
 		 415 aa  226  8e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  32.66 
 
 		 427 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  32.88 
 
 		 422 aa  222  9e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  32.88 
 
 		 422 aa  222  9e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  33.74 
 
 		 412 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  31.11 
 
 		 403 aa  219  1e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  32.72 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  34.19 
 
 		 393 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  33.72 
 
 		 390 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  33.18 
 
 		 430 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  32.71 
 
 		 408 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  32.56 
 
 		 406 aa  206  7e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  32.56 
 
 		 406 aa  206  7e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  32.71 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  34.89 
 
 		 419 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  32.87 
 
 		 408 aa  206  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  32.59 
 
 		 419 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  30.77 
 
 		 414 aa  204  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  31.59 
 
 		 423 aa  202  9e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  31.59 
 
 		 423 aa  202  9e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  31.59 
 
 		 423 aa  202  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  31.59 
 
 		 423 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  31.59 
 
 		 423 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  31.59 
 
 		 423 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  31.59 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  31.36 
 
 		 423 aa  201  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  31.59 
 
 		 423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  30.54 
 
 		 415 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  31.59 
 
 		 423 aa  200  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  30.45 
 
 		 426 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  33.48 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  31.44 
 
 		 436 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  30.3 
 
 		 412 aa  192  7e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  33.02 
 
 		 435 aa  188  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1282  hypothetical protein  29.6 
 
 		 403 aa  186  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.488791  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3520  HI0933 family protein  30.86 
 
 		 408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  32 
 
 		 435 aa  184  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  32.01 
 
 		 435 aa  182  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  30.12 
 
 		 414 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  28.68 
 
 		 413 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2067  hypothetical protein  31.99 
 
 		 415 aa  177  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 401 aa  176  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  30.07 
 
 		 404 aa  176  6e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5845  HI0933 family protein  27.61 
 
 		 408 aa  176  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  28.87 
 
 		 446 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  29.28 
 
 		 414 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2316  hypothetical protein  30.37 
 
 		 410 aa  169  8e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0791  HI0933 family protein  29.91 
 
 		 408 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15361  flavoprotein  29.12 
 
 		 411 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0647863  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0017  hypothetical protein  32.13 
 
 		 422 aa  166  5.9999999999999996e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1467  hypothetical protein  29.52 
 
 		 415 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2502  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  29.78 
 
 		 413 aa  166  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.472711  normal  0.7121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5032  HI0933 family protein  29.89 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  31.38 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15731  flavoprotein  29.37 
 
 		 410 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1007  hypothetical protein  32.87 
 
 		 389 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15581  flavoprotein  29.67 
 
 		 414 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379962  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  30.35 
 
 		 394 aa  162  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  31.95 
 
 		 399 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1503  hypothetical protein  31.21 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1530  hypothetical protein  30.75 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07621  hypothetical protein  28.51 
 
 		 407 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1076  HI0933 family protein  28.22 
 
 		 407 aa  162  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0249257  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0130  hypothetical protein  28.51 
 
 		 405 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.700212  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00161  hypothetical protein  34.64 
 
 		 440 aa  161  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  29.4 
 
 		 397 aa  159  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  29.63 
 
 		 397 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  30.54 
 
 		 396 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  31 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  30.19 
 
 		 394 aa  156  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0128  hypothetical protein  30.32 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0603016  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1574  HI0933 family protein  28.25 
 
 		 409 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1463  hypothetical protein  30.93 
 
 		 392 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261664  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2832  flavoprotein  31.4 
 
 		 392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1597  HI0933 family protein  29.03 
 
 		 409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.168995 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1396  hypothetical protein  26.96 
 
 		 402 aa  154  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1787  hypothetical protein  32.12 
 
 		 406 aa  154  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000418833 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  29.77 
 
 		 398 aa  154  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1308  HI0933 family protein  29.75 
 
 		 426 aa  154  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0313133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  29.58 
 
 		 393 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1899  HI0933 family protein  28.34 
 
 		 409 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.279809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>