More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1787 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1787  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  823    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000418833 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  71.83 
 
 		 414 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2884  HI0933-like protein  62.14 
 
 		 414 aa  522  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2846  hypothetical protein  63.79 
 
 		 413 aa  509  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1400  hypothetical protein  63.97 
 
 		 415 aa  511  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.615162  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3283  HI0933-like protein  63.59 
 
 		 416 aa  508  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2335  HI0933 family protein  63.55 
 
 		 413 aa  508  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00707215  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2364  hypothetical protein  63.82 
 
 		 406 aa  498  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2097  hypothetical protein  63.11 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234168  normal  0.897923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3539  HI0933 family protein  62.38 
 
 		 402 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.110532  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  58.44 
 
 		 405 aa  475  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0885  hypothetical protein  61.76 
 
 		 416 aa  463  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3779  hypothetical protein  60.51 
 
 		 405 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28946  normal  0.0295291 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4817  hypothetical protein  60.87 
 
 		 406 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.571028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2824  HI0933-like protein  58.02 
 
 		 405 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3253  hypothetical protein  60 
 
 		 405 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0198176 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2388  FAD-dependent oxidoreductase  57.43 
 
 		 407 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396449  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3645  hypothetical protein  59.85 
 
 		 406 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0335  hypothetical protein  57.43 
 
 		 407 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0368  FAD-dependent oxidoreductase  57.43 
 
 		 407 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0837  hypothetical protein  57.43 
 
 		 407 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1516  hypothetical protein  57.43 
 
 		 407 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2208  hypothetical protein  58.37 
 
 		 406 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2530  FAD-dependent oxidoreductase  57.43 
 
 		 407 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4483  HI0933-like protein  59.85 
 
 		 406 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1709  hypothetical protein  57.43 
 
 		 407 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3882  hypothetical protein  59.85 
 
 		 406 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.151985 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6778  HI0933 family protein  58.45 
 
 		 390 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763254 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0617  hypothetical protein  58.21 
 
 		 407 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2610  hypothetical protein  60.5 
 
 		 378 aa  441  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624584  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2218  putative transmembrane protein  57.89 
 
 		 412 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2423  HI0933 family protein  58.38 
 
 		 407 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2030  HI0933 family protein  57.87 
 
 		 407 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  53.09 
 
 		 397 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  54.29 
 
 		 394 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  53.48 
 
 		 396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  54.43 
 
 		 399 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  51.49 
 
 		 394 aa  403  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0592  HI0933 family protein  51.49 
 
 		 405 aa  399  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  52.9 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  52.51 
 
 		 398 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  52.51 
 
 		 398 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  52.51 
 
 		 398 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  52.51 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  52.26 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  51.23 
 
 		 398 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  51.39 
 
 		 413 aa  391  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  50.99 
 
 		 399 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  50.98 
 
 		 460 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  52.27 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1357  hypothetical protein  52.69 
 
 		 409 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.999189  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  48.87 
 
 		 397 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  51.39 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  47.58 
 
 		 401 aa  386  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  50.74 
 
 		 460 aa  386  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  50.51 
 
 		 393 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  51.51 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  49.23 
 
 		 398 aa  385  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  49.24 
 
 		 393 aa  383  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  50.38 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03341  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  52.51 
 
 		 400 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.542782  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0223  HI0933 family protein  52.51 
 
 		 400 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  46.85 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  51.01 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2832  flavoprotein  52.76 
 
 		 392 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03294  hypothetical protein  52.51 
 
 		 400 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1635  hypothetical protein  47.42 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  50.88 
 
 		 392 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4487  HI0933 family protein  50.99 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3830  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  52.26 
 
 		 400 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  48.75 
 
 		 394 aa  381  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3974  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  52.01 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4838  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  52.26 
 
 		 400 aa  378  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3691  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  52.01 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2099  hypothetical protein  50.13 
 
 		 396 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  48.25 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3781  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  52.01 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1513  hypothetical protein  51.51 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0224  hypothetical protein  52.01 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  48 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1463  hypothetical protein  52.76 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261664  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  48.61 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  49.87 
 
 		 392 aa  373  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  48.12 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  48 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  47.12 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  47.5 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0691  HI0933 family protein  50.12 
 
 		 414 aa  371  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  50.13 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1441  HI0933-like protein  50 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3906  hypothetical protein  50.39 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  47.37 
 
 		 394 aa  368  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  45.69 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2552  hypothetical protein  45.34 
 
 		 393 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  47.88 
 
 		 394 aa  368  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  51.39 
 
 		 411 aa  368  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  48.48 
 
 		 394 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  48.22 
 
 		 394 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0801  hypothetical protein  51.65 
 
 		 395 aa  364  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2680  hypothetical protein  45.34 
 
 		 393 aa  363  3e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>