286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4868 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008759  Pnap_4868  di-haem cytochrome c peroxidase  100 
 
 
424 aa  867    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4466  di-haem cytochrome c peroxidase  65.02 
 
 
427 aa  558  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2642  di-haem cytochrome c peroxidase  49.1 
 
 
409 aa  355  7.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1885  Di-heme cytochrome c peroxidase  39.76 
 
 
416 aa  308  8e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0712604  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5043  Di-heme cytochrome c peroxidase  38.48 
 
 
440 aa  237  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.772632  normal  0.822477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  30.48 
 
 
369 aa  169  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 
431 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  34.29 
 
 
336 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  30.68 
 
 
346 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  29.13 
 
 
379 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  29.78 
 
 
330 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4030  beta strand repeat-containing protein  39.74 
 
 
261 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.56373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  31.1 
 
 
398 aa  140  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  32.35 
 
 
768 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  28.21 
 
 
343 aa  134  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  32.88 
 
 
357 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  28.09 
 
 
365 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  29.25 
 
 
334 aa  127  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  27.95 
 
 
377 aa  126  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  29.72 
 
 
311 aa  126  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  29.67 
 
 
337 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  28.5 
 
 
594 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  31.06 
 
 
365 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  29.29 
 
 
358 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  27.95 
 
 
521 aa  123  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  30.21 
 
 
353 aa  123  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  27.53 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  31.39 
 
 
431 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  30.52 
 
 
348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  29.72 
 
 
328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  29.33 
 
 
598 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  27.83 
 
 
384 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  31.85 
 
 
399 aa  117  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  27.92 
 
 
347 aa  116  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  29.33 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  28.81 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  29.78 
 
 
626 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  26.9 
 
 
304 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  29.43 
 
 
417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  28.34 
 
 
358 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  26.29 
 
 
360 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  27.97 
 
 
302 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  26.63 
 
 
304 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  27.79 
 
 
342 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  28.57 
 
 
348 aa  106  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  30.75 
 
 
361 aa  106  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  27.08 
 
 
345 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  29.58 
 
 
464 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  27.53 
 
 
371 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  31.65 
 
 
473 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  27.47 
 
 
346 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  28.39 
 
 
352 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  28.25 
 
 
331 aa  104  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  29.83 
 
 
398 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  27.23 
 
 
383 aa  104  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  28.89 
 
 
345 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  28.45 
 
 
322 aa  104  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  28.46 
 
 
352 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  28.89 
 
 
571 aa  103  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  26.61 
 
 
352 aa  102  9e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  27.65 
 
 
390 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  27.07 
 
 
333 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  26.82 
 
 
339 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  29.92 
 
 
352 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  27.42 
 
 
359 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  26.52 
 
 
352 aa  102  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  28.61 
 
 
346 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  32.03 
 
 
367 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  26.9 
 
 
345 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  27.17 
 
 
368 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  27.3 
 
 
373 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  25.82 
 
 
330 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  28.65 
 
 
594 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  30.59 
 
 
332 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  26.54 
 
 
330 aa  100  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  27.22 
 
 
346 aa  100  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  30 
 
 
427 aa  99.8  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  26.69 
 
 
333 aa  99  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  26.52 
 
 
333 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  29 
 
 
346 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  26.24 
 
 
333 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  29.93 
 
 
332 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  26.24 
 
 
333 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  25.14 
 
 
344 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  26.78 
 
 
384 aa  97.4  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  25.14 
 
 
344 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  25.14 
 
 
344 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  25.14 
 
 
344 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  27.86 
 
 
328 aa  97.1  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  26.98 
 
 
437 aa  97.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  25.71 
 
 
345 aa  97.1  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  28.73 
 
 
346 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  24.94 
 
 
333 aa  97.1  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  26.52 
 
 
330 aa  95.1  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  28.38 
 
 
347 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  25.8 
 
 
306 aa  95.5  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  29.07 
 
 
428 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  23.93 
 
 
351 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  28.73 
 
 
314 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  27.42 
 
 
330 aa  94.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0489303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>