More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3784 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3784  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
775 aa  1548    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0161451  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1172  heavy metal translocating P-type ATPase  62.83 
 
 
817 aa  851    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  54.43 
 
 
765 aa  683    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1927  heavy metal translocating P-type ATPase  68.01 
 
 
795 aa  971    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1521  heavy metal translocating P-type ATPase  65.45 
 
 
830 aa  870    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0875658  normal  0.721674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2773  heavy metal translocating P-type ATPase  61.56 
 
 
824 aa  852    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0998  heavy metal translocating P-type ATPase  64.57 
 
 
802 aa  880    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4307  heavy metal translocating P-type ATPase  59.42 
 
 
760 aa  767    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127036  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2816  heavy metal translocating P-type ATPase  61.41 
 
 
777 aa  843    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  62.48 
 
 
813 aa  878    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  50.2 
 
 
805 aa  618  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  44.37 
 
 
812 aa  572  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  44.39 
 
 
839 aa  546  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  41.37 
 
 
811 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  41.37 
 
 
811 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  43.05 
 
 
847 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  41.48 
 
 
834 aa  504  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1102  heavy metal translocating P-type ATPase  43.05 
 
 
847 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165186  normal  0.905045 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  44.4 
 
 
851 aa  490  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  40.28 
 
 
838 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  42.95 
 
 
802 aa  489  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  42.09 
 
 
846 aa  481  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  41.28 
 
 
824 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  41.02 
 
 
882 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  40.89 
 
 
824 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  41.74 
 
 
823 aa  475  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  41.52 
 
 
814 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2046  heavy metal translocating P-type ATPase  43.1 
 
 
861 aa  467  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504527  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  38.19 
 
 
815 aa  465  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  41.18 
 
 
800 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  39.69 
 
 
816 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  40.21 
 
 
826 aa  462  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2043  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  42.38 
 
 
849 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  40.34 
 
 
824 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  36.62 
 
 
803 aa  450  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  36.01 
 
 
807 aa  451  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  36.48 
 
 
803 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  35.39 
 
 
799 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  35.39 
 
 
799 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  34.32 
 
 
794 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  35.61 
 
 
799 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  36.75 
 
 
795 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  36.58 
 
 
803 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.79 
 
 
790 aa  439  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  35.57 
 
 
787 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1365  heavy metal translocating P-type ATPase  37.73 
 
 
810 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.576345 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  37.39 
 
 
806 aa  437  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.59 
 
 
799 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0451  heavy metal translocating P-type ATPase  38.41 
 
 
811 aa  433  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0831309  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  36.64 
 
 
819 aa  430  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  32.36 
 
 
820 aa  432  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  35.75 
 
 
787 aa  430  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  36.83 
 
 
794 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  35.19 
 
 
799 aa  430  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  35.14 
 
 
797 aa  431  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  34.63 
 
 
791 aa  426  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  35.26 
 
 
799 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  35.19 
 
 
792 aa  427  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  34.72 
 
 
802 aa  426  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  35.17 
 
 
813 aa  422  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  34.87 
 
 
799 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  34.91 
 
 
792 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  33.51 
 
 
796 aa  406  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  37.19 
 
 
818 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  33.66 
 
 
791 aa  393  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  36.95 
 
 
743 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  34.06 
 
 
807 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6713  copper-translocating P-type ATPase  38.48 
 
 
758 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  30.41 
 
 
806 aa  365  1e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  37.62 
 
 
732 aa  364  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  32.11 
 
 
828 aa  363  7.0000000000000005e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2797  nitrogen fixation protein fixI  36.45 
 
 
733 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350165  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  34.01 
 
 
728 aa  357  5.999999999999999e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0667  nitrogen fixation protein fixI  36.77 
 
 
729 aa  356  1e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  36.31 
 
 
731 aa  355  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  35.68 
 
 
731 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7463  copper-translocating P-type ATPase  37.87 
 
 
758 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  38.23 
 
 
737 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  35.13 
 
 
732 aa  352  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1670  heavy metal translocating P-type ATPase  38.34 
 
 
648 aa  352  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  38.19 
 
 
737 aa  350  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.231434 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0690  copper-translocating P-type ATPase, RdxI  38.19 
 
 
737 aa  350  5e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247145  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  34.32 
 
 
814 aa  350  5e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  34.81 
 
 
738 aa  349  9e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3789  copper-translocating P-type ATPase  32.61 
 
 
860 aa  347  4e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  32.23 
 
 
814 aa  347  4e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  34.03 
 
 
806 aa  346  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  30.51 
 
 
817 aa  346  1e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  33.87 
 
 
735 aa  346  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  32.11 
 
 
808 aa  345  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  28.87 
 
 
793 aa  343  5e-93  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  33.66 
 
 
806 aa  343  9e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1420  copper-translocating P-type ATPase  31.67 
 
 
789 aa  342  1e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2538  heavy metal translocating P-type ATPase  36.23 
 
 
727 aa  342  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  35.45 
 
 
740 aa  341  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1665  heavy metal translocating P-type ATPase  32.31 
 
 
774 aa  340  7e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000242647  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  31.89 
 
 
828 aa  339  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  32.16 
 
 
794 aa  339  9.999999999999999e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0267  copper-translocating P-type ATPase  31.39 
 
 
797 aa  338  2.9999999999999997e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.594062  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2572  heavy metal translocating P-type ATPase  35.92 
 
 
707 aa  338  2.9999999999999997e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>