104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1510 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 
523 aa  1024    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  28.09 
 
 
585 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  29.5 
 
 
564 aa  110  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  31.72 
 
 
589 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  24.86 
 
 
585 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  26.82 
 
 
585 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  26.67 
 
 
583 aa  98.2  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  24.07 
 
 
587 aa  98.2  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  27.82 
 
 
546 aa  94.7  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  24.15 
 
 
548 aa  87.4  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  25.83 
 
 
632 aa  83.2  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  25.7 
 
 
1164 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  27.7 
 
 
599 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  25.28 
 
 
615 aa  65.1  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  23.74 
 
 
693 aa  64.7  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  21.56 
 
 
605 aa  63.9  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  26.64 
 
 
601 aa  61.6  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  27.83 
 
 
1219 aa  61.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  27.83 
 
 
1219 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  27.83 
 
 
1219 aa  61.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  27.83 
 
 
1219 aa  60.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  27.83 
 
 
1219 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  27.83 
 
 
1219 aa  61.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  27.83 
 
 
1219 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  27.83 
 
 
1219 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  27.83 
 
 
1219 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  27.83 
 
 
1219 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  24.88 
 
 
674 aa  61.2  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  25.29 
 
 
1145 aa  60.5  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  24 
 
 
1219 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  25.34 
 
 
620 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  25.6 
 
 
1146 aa  58.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  25.6 
 
 
1146 aa  58.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  20.46 
 
 
614 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  20.46 
 
 
614 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  24.7 
 
 
610 aa  55.8  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  24.89 
 
 
712 aa  54.3  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  24.89 
 
 
712 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2082  GTP-binding protein Era  29.17 
 
 
313 aa  54.3  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592415  normal  0.853182 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  22.22 
 
 
407 aa  53.9  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  24.22 
 
 
1249 aa  53.5  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  29.17 
 
 
475 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  28.09 
 
 
666 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  24.55 
 
 
444 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  24.38 
 
 
1228 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  25 
 
 
664 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  27.27 
 
 
297 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  21.43 
 
 
551 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  22.29 
 
 
603 aa  51.2  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2033  GTP-binding protein, HSR1-related  23.67 
 
 
569 aa  50.8  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291841 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  22.87 
 
 
692 aa  50.8  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  26.75 
 
 
468 aa  50.4  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  24.24 
 
 
728 aa  49.7  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  22.18 
 
 
588 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  23.32 
 
 
728 aa  50.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  23.83 
 
 
728 aa  49.7  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  29.49 
 
 
440 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  24.06 
 
 
693 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  26.32 
 
 
686 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2750  hypothetical protein  23.72 
 
 
606 aa  49.3  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.788523  normal  0.0959696 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  24.74 
 
 
569 aa  48.9  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3138  hypothetical protein  26.09 
 
 
788 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0143921  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  21.71 
 
 
605 aa  48.5  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0117  tRNA modification GTPase TrmE  33.56 
 
 
455 aa  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  22.89 
 
 
602 aa  48.5  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  20.86 
 
 
619 aa  48.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  26.81 
 
 
307 aa  48.1  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  24.57 
 
 
976 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8770  predicted protein  23.08 
 
 
390 aa  47.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  26.42 
 
 
479 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  24.79 
 
 
569 aa  47.4  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  30.47 
 
 
566 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  27.63 
 
 
479 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  23.7 
 
 
952 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5964  hypothetical protein  24.29 
 
 
641 aa  47  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285067  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.23 
 
 
472 aa  46.6  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1825  GTP-binding protein Era  29.33 
 
 
309 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  23.83 
 
 
692 aa  46.6  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  29.61 
 
 
298 aa  46.6  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30394  predicted protein  23.76 
 
 
559 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.382636  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  19.59 
 
 
566 aa  46.6  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  25.68 
 
 
687 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  24.79 
 
 
569 aa  45.8  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.93 
 
 
457 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  29.08 
 
 
324 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  27.32 
 
 
481 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  29.71 
 
 
460 aa  45.8  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  28.28 
 
 
453 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0968  small GTP-binding protein  25 
 
 
501 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.51 
 
 
492 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  22.75 
 
 
420 aa  45.1  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  29.22 
 
 
300 aa  45.4  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  34.53 
 
 
452 aa  44.3  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  27.06 
 
 
468 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  23.4 
 
 
568 aa  44.3  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  21.74 
 
 
564 aa  44.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  25.61 
 
 
626 aa  44.3  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  22.02 
 
 
614 aa  43.9  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  33.33 
 
 
655 aa  43.9  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  33.33 
 
 
655 aa  43.9  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>