More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2595 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 265 aa  546  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  81.78 
 
 		 269 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  80.69 
 
 		 276 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  80.31 
 
 		 276 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  76.32 
 
 		 266 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  75.56 
 
 		 266 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  68.36 
 
 		 259 aa  357  9e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  67.97 
 
 		 259 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  68.75 
 
 		 259 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  67.19 
 
 		 259 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  55.94 
 
 		 264 aa  290  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  56.54 
 
 		 273 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  52.69 
 
 		 273 aa  275  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  47.1 
 
 		 263 aa  218  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  44.27 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  43.89 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  41.76 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  42.22 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  41.24 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  41.79 
 
 		 274 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  37.22 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  39.92 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  39.78 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  39.78 
 
 		 287 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  39.7 
 
 		 296 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  41.51 
 
 		 274 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  39.7 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  43.35 
 
 		 278 aa  185  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  42.47 
 
 		 282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  41.73 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  39.85 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  40.52 
 
 		 282 aa  178  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  41.51 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  38.13 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  37.68 
 
 		 273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  38.55 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  38.01 
 
 		 265 aa  168  7e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  37.5 
 
 		 265 aa  168  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  39 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  38.18 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  37.27 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  37.26 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  39.03 
 
 		 268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  38.78 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  38.58 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  38.91 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  38.25 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  36.5 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  39.15 
 
 		 269 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  35.99 
 
 		 299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  38.95 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  36.33 
 
 		 270 aa  148  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  34.69 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  34.42 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  35.29 
 
 		 272 aa  146  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  34.74 
 
 		 367 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  34.74 
 
 		 366 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  36.59 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  34.32 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  34.42 
 
 		 361 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  33.45 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  35.37 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  33.12 
 
 		 352 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  33.57 
 
 		 326 aa  139  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  33.77 
 
 		 352 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  32.6 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  32.97 
 
 		 273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  33.22 
 
 		 345 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  32.36 
 
 		 339 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  32.9 
 
 		 340 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  32.9 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  32.57 
 
 		 340 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  32.58 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  32.57 
 
 		 338 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  32.57 
 
 		 338 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  32.01 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  32.57 
 
 		 338 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  33.09 
 
 		 272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  32.75 
 
 		 308 aa  132  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0045  transglutaminase-like protein  36.1 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607602  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2219  transglutaminase domain protein  33.58 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219204 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  35.29 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  32.99 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  31.62 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  33.09 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  33.68 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  34.11 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3726  transglutaminase domain protein  34.46 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4408  transglutaminase domain protein  34.13 
 
 		 296 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.80946 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  32.62 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3417  transglutaminase domain-containing protein  33.9 
 
 		 300 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.331503  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  30.58 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  29.76 
 
 		 304 aa  127  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  32.49 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  32.11 
 
 		 316 aa  126  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3610  transglutaminase domain protein  34.01 
 
 		 298 aa  126  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0089149  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  32.13 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3583  transglutaminase-like  31.27 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  32.07 
 
 		 299 aa  125  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  32.26 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>