49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3405 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 		 321 aa  651    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  54.55 
 
 		 326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  50.18 
 
 		 322 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  42.51 
 
 		 308 aa  235  8e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  34.71 
 
 		 629 aa  80.1  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  31.89 
 
 		 482 aa  79.7  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0676  protein of unknown function DUF1080  35.95 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  30.52 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  31.67 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  30.82 
 
 		 595 aa  73.2  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  31.85 
 
 		 628 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  30.18 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  31.76 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  30.52 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  31.75 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  33.33 
 
 		 1145 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  29.95 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  28.3 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  28.9 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  28.24 
 
 		 247 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  31.58 
 
 		 1140 aa  60.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3945  protein of unknown function DUF1080  30.41 
 
 		 540 aa  59.3  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  29.02 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  29.81 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  29.68 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  26.94 
 
 		 786 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0038  protein of unknown function DUF1080  31.54 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0813  protein of unknown function DUF1080  27.4 
 
 		 240 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  30.32 
 
 		 234 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  29.08 
 
 		 222 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  32.37 
 
 		 352 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  29.56 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1099  hypothetical protein  29.53 
 
 		 579 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699009  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  27.93 
 
 		 255 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  29.76 
 
 		 237 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  29.5 
 
 		 451 aa  52.8  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  28.1 
 
 		 260 aa  52.8  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  27.39 
 
 		 197 aa  50.1  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  28.38 
 
 		 198 aa  49.3  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  26.02 
 
 		 231 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  28.83 
 
 		 239 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  23.2 
 
 		 447 aa  46.6  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  24.87 
 
 		 247 aa  45.8  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  26.01 
 
 		 238 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2283  protein of unknown function DUF1080  26.99 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835923  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  28.18 
 
 		 453 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  27.86 
 
 		 215 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1162  protein of unknown function DUF1080  27.75 
 
 		 253 aa  43.5  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  26.47 
 
 		 241 aa  43.5  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>