More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1175 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1175  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
185 aa  368  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7806  putative small heat-shock protein molecular chaperone  33.58 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00540773  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  30.61 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  36.11 
 
 
162 aa  82  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  32.54 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  39.81 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  33.11 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  38.83 
 
 
195 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  34.27 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  29.3 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
149 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  34.48 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  38.83 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  29.71 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  31.69 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  38.06 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  28.77 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  39.25 
 
 
141 aa  73.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  35.24 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  34.35 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  31.75 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0423  heat shock protein Hsp20  30.37 
 
 
152 aa  72  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943695  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 
148 aa  72  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  33.8 
 
 
148 aa  72  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  32.8 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  27.97 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  34.11 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  32.21 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  36.56 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  27.97 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  32.69 
 
 
148 aa  70.5  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3460  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 
137 aa  70.5  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.895888  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  27.92 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0188  heat shock protein Hsp20  29.79 
 
 
150 aa  70.5  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3667  heat shock protein Hsp20  34.82 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1704  heat shock protein Hsp20  32.58 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  28.1 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5150  heat shock protein Hsp20  29.08 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  30.58 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  30.14 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  34.65 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  37.36 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  26.53 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  31.03 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  32.69 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  31.37 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5262  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.100267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  39.78 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  26.15 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  35.64 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  29.29 
 
 
146 aa  67  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  30.3 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  29.58 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  34.78 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  30.32 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  29.71 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  32.69 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2580  putative small heat shock protein, Hsp20-related  28.77 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  31.9 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  35.45 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  29.71 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  29.58 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  30.69 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  30.69 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  32.04 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  28.77 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  30.11 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  31.08 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  33.65 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7808  Hsp20 family heat-shock protein  40.22 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00255696  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  35.16 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  31.9 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  27.88 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  34.41 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  25.83 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1142  heat shock protein Hsp20  31.03 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0859  heat shock protein Hsp20  34.74 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  28.19 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0250  HSP20 family protein  30.69 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.962825  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  28.95 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0391  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.854862  normal  0.714918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>