215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5169 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5169  hypothetical protein  100 
 
 		 704 aa  1455    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.882011  normal  0.19488 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1673  hypothetical protein  38.78 
 
 		 681 aa  420  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.617878 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2590  cytochrome c peroxidase family protein, putative  37.72 
 
 		 773 aa  360  6e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.959599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4292  hypothetical protein  45.62 
 
 		 473 aa  138  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.223034 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  24.51 
 
 		 336 aa  96.7  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  29.57 
 
 		 398 aa  87.8  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  29.15 
 
 		 626 aa  87  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5043  Di-heme cytochrome c peroxidase  23.92 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.772632  normal  0.822477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  27.56 
 
 		 346 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  28.4 
 
 		 571 aa  81.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4466  di-haem cytochrome c peroxidase  24.78 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  25.48 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  28.23 
 
 		 607 aa  77.8  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  28.63 
 
 		 616 aa  75.1  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  27.31 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  26.42 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1885  Di-heme cytochrome c peroxidase  25.56 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0712604  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  29.86 
 
 		 349 aa  72  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  28.1 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2642  di-haem cytochrome c peroxidase  28.92 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  26.02 
 
 		 379 aa  70.5  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4868  di-haem cytochrome c peroxidase  28.63 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  25.41 
 
 		 345 aa  67  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  40.18 
 
 		 598 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  42.11 
 
 		 357 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  26.04 
 
 		 358 aa  66.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  22.17 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  29.19 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  27.96 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  26.77 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  26.79 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  25.99 
 
 		 346 aa  63.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  42.39 
 
 		 353 aa  63.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  26.98 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  25.47 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  26.52 
 
 		 346 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  44.57 
 
 		 594 aa  63.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  42.22 
 
 		 431 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  26.58 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  26.09 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  26.09 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  26.09 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  26.09 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04385  Di-heme cytochrome c peroxidase  48.21 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  40.4 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  26.22 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  44.44 
 
 		 613 aa  60.1  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  24.7 
 
 		 373 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  26.74 
 
 		 398 aa  60.1  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  25.6 
 
 		 465 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  27.68 
 
 		 322 aa  59.7  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  24.36 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  39.13 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  51.79 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  40 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  59.52 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  33.72 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  52 
 
 		 346 aa  57  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  45.61 
 
 		 345 aa  57.4  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  26.07 
 
 		 340 aa  57.4  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  25.6 
 
 		 465 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  25.6 
 
 		 465 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  25 
 
 		 466 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  43.86 
 
 		 345 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  25 
 
 		 466 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  25 
 
 		 466 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  29.84 
 
 		 369 aa  56.2  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  25 
 
 		 466 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  26.15 
 
 		 333 aa  56.2  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  45.1 
 
 		 594 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  37.61 
 
 		 378 aa  55.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  38.04 
 
 		 311 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  53.19 
 
 		 343 aa  55.5  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  66.67 
 
 		 768 aa  55.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  69.7 
 
 		 626 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  52.94 
 
 		 330 aa  55.1  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  25.97 
 
 		 474 aa  54.7  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  49.02 
 
 		 330 aa  54.7  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  36.47 
 
 		 352 aa  54.7  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  48 
 
 		 346 aa  54.3  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  25.6 
 
 		 466 aa  54.3  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  45.28 
 
 		 359 aa  54.3  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  36.47 
 
 		 352 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  44.64 
 
 		 334 aa  53.9  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  25.71 
 
 		 456 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  47.17 
 
 		 347 aa  53.9  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  46 
 
 		 358 aa  52.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  34.68 
 
 		 417 aa  53.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  33.91 
 
 		 393 aa  52.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  53.06 
 
 		 302 aa  53.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3118  cytochrome C peroxidase  31.5 
 
 		 662 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  25.6 
 
 		 463 aa  52.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01549  cytochrome-c peroxidase  33.72 
 
 		 330 aa  52  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  26.4 
 
 		 360 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  47.17 
 
 		 339 aa  52.4  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  63.16 
 
 		 361 aa  52.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  25.27 
 
 		 448 aa  52.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  34.26 
 
 		 390 aa  52  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  39.08 
 
 		 367 aa  52  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  36.14 
 
 		 328 aa  52  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>