More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2780 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2780  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 216 aa  446  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.668811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2839  electron transport protein SCO1/SenC  52.2 
 
 		 207 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.819932 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1519  PrrC  52.72 
 
 		 231 aa  208  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0171  electron transport protein SCO1/SenC  52.72 
 
 		 231 aa  208  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.474246  normal  0.536403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3431  regulatory protein SenC  49 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4059  electron transport protein SCO1/SenC  50.49 
 
 		 210 aa  201  7e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2958  electron transport protein SCO1/SenC  50.81 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0515097 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  42.48 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  43.59 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  35 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  40.97 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  40.74 
 
 		 287 aa  119  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  36.04 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  35.06 
 
 		 291 aa  117  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  36.48 
 
 		 286 aa  112  5e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  34.34 
 
 		 203 aa  111  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  37.33 
 
 		 198 aa  112  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  43.08 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  33.13 
 
 		 297 aa  108  6e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  34 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  37.4 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  36.76 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  36.76 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  33.66 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  34.78 
 
 		 187 aa  106  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  39.84 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  36.96 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  31.28 
 
 		 196 aa  105  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  37.58 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  35.11 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  33.93 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  32.42 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  33.66 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  34.04 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  31.14 
 
 		 193 aa  101  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  33.96 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  36.15 
 
 		 199 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  39.84 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  36.99 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  36.99 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  34.9 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  36.99 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  36.99 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  36.99 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  34.62 
 
 		 199 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  36.99 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  37.27 
 
 		 275 aa  99  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  37.4 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  36.15 
 
 		 196 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  31.61 
 
 		 197 aa  99  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  38.69 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  34.88 
 
 		 197 aa  98.6  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 197 aa  98.6  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  32.24 
 
 		 201 aa  98.2  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  40.15 
 
 		 185 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  33.08 
 
 		 200 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  34.78 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  31.67 
 
 		 209 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  36.5 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  32.37 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  34.52 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  33.08 
 
 		 200 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  36.2 
 
 		 226 aa  95.5  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  30.77 
 
 		 199 aa  95.5  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  36.99 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  33.8 
 
 		 221 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  34.25 
 
 		 192 aa  95.5  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  32.91 
 
 		 206 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  36.02 
 
 		 217 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  35.58 
 
 		 211 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7280  Electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 166 aa  95.1  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  35.58 
 
 		 211 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  35.58 
 
 		 211 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  35.58 
 
 		 217 aa  95.1  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  31.79 
 
 		 203 aa  94.7  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  31.55 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  34.27 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  31.55 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  33.54 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  34.48 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  33.12 
 
 		 200 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  35.62 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  32.92 
 
 		 191 aa  94  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  36.51 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  34.48 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  35.03 
 
 		 206 aa  92.4  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14770  predicted protein  29.63 
 
 		 171 aa  91.3  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00224901  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  31.76 
 
 		 194 aa  91.3  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  34.59 
 
 		 196 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  31.85 
 
 		 181 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  30.6 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  31.58 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  38.93 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  32.12 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>