137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1455 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1455  major facilitator transporter  100 
 
 		 411 aa  795    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3596  major facilitator transporter  50 
 
 		 398 aa  325  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  48.68 
 
 		 394 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0225  protein of unknown function DUF1228  47.63 
 
 		 395 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0334  major facilitator superfamily MFS_1  48.28 
 
 		 395 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0241  major facilitator transporter  49.48 
 
 		 393 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.616236  normal  0.0363881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0339  major facilitator superfamily permease  47.01 
 
 		 399 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  0.0205502 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2883  major facilitator transporter  40.31 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000788215 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3608  major facilitator transporter  40.99 
 
 		 416 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2507  hypothetical protein  40.81 
 
 		 443 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2826  major facilitator superfamily MFS_1  43.13 
 
 		 380 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.160845 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5344  major facilitator transporter  40.42 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3912  major facilitator transporter  40.89 
 
 		 416 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5090  major facilitator transporter  39.55 
 
 		 416 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7222  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0434  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1033  major facilitator transporter  39.68 
 
 		 389 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2373  MFS family transporter  39.68 
 
 		 389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.098036  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3514  major facilitator transporter  39.48 
 
 		 415 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.747582  normal  0.0415191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8502  major facilitator transporter  35.93 
 
 		 388 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0169  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1585  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 403 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  29.18 
 
 		 428 aa  106  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0358  hypothetical protein  28.16 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.23836  unclonable  0.0000000671481 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4896  hypothetical protein  26.05 
 
 		 395 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0856  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 397 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0484  hypothetical protein  30.81 
 
 		 400 aa  99.4  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2649  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 389 aa  94.7  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.189084 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3043  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 394 aa  92.8  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.890919 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0386  hypothetical protein  30.26 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1231  major facilitator superfamily tranporter  27.14 
 
 		 428 aa  90.5  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1160  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 433 aa  90.5  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0149798 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0279  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 398 aa  90.1  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3310  MFS permease  28.91 
 
 		 401 aa  89.7  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.641652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 398 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3120  protein of unknown function DUF1228  30.66 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1737  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 413 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2851  protein of unknown function DUF1228  30.66 
 
 		 394 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2332  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6538  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0856  hypothetical protein  28.53 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1047  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4509  hypothetical protein  27.96 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4528  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1559  hypothetical protein  29.2 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0806  hypothetical protein  28.85 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1488  hypothetical protein  28.65 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6839  protein of unknown function DUF1228  27.72 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480421  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0557  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0349703  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1909  major facilitator family transporter  26.3 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1291  hypothetical protein  28.53 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0821  protein of unknown function DUF1228  27.34 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  0.29655 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4560  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3732  hypothetical protein  27.68 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000100771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1041  hypothetical protein  27.52 
 
 		 428 aa  69.7  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4932  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4773  transporter, major facilitator family  27.42 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04201  predicted inner membrane protein  27.22 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000208654  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3664  protein of unknown function DUF1228  27.22 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330121  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3309  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04164  hypothetical protein  27.22 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000012722  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1953  hypothetical protein  28.95 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2822  protein of unknown function DUF1228  27.12 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4555  hypothetical protein  28.53 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2647  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.652327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7234  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4772  transporter major facilitator family  27.55 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4526  hypothetical protein  29.51 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5539  hypothetical protein  26.65 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188295  normal  0.0555001 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1330  hypothetical protein  27.87 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4846  transporter, major facilitator family  27 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4918  major facilitator family transporter  27 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  0.222303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4870  major facilitator family protein  27 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.444375 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4033  hypothetical protein  30.19 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253788 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5844  transporter, major facilitator family  26.87 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.482212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0751  protein of unknown function DUF1228  27.37 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4877  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1651  hypothetical protein  29.49 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0231704  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0445  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4306  major facilitator superfamily transporter  28.41 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0575629 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2471  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3678  protein of unknown function DUF1228  28.11 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2569  hypothetical protein  28.65 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0634  protein of unknown function DUF1228  27.73 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1213  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451147 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0733  hypothetical protein  24.06 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.162418  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6744  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.713185 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4318  hypothetical protein  28.76 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0616031  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0072  hypothetical protein  25.71 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4920  major facilitator family transporter  26.72 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.177935  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0805  hypothetical protein  31.82 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1449  hypothetical protein  27.66 
 
 		 393 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0209  protein of unknown function DUF1228  29.81 
 
 		 422 aa  53.5  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0190  hypothetical protein  31.2 
 
 		 422 aa  53.1  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0330  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.422618  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0485  hypothetical protein  29.83 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.626037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  26.29 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1389  hypothetical protein  26.94 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290756 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0308  hypothetical protein  35.62 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>