More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0789 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  100 
 
 		 124 aa  235  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  56 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  56 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  54.03 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  53.23 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  53.33 
 
 		 125 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  47.93 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  52.5 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  51.64 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  47.54 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  49.21 
 
 		 125 aa  97.4  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  47.11 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  54.7 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0623  camphor resistance protein CrcB  54.35 
 
 		 105 aa  94.7  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  50.41 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  49.57 
 
 		 124 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  48.6 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  49.6 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  52.17 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  50 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  45.45 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  43.44 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  49.14 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  47.97 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  49.55 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  47.41 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  51.22 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  43.75 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  47.46 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  49.51 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  47.41 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  44.54 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  41.73 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2957  camphor resistance protein CrcB  43.93 
 
 		 170 aa  77  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  38.4 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  45.45 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  47.27 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  41.6 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  44.64 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  45.45 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  44 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  43.9 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  45.6 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  44.54 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  38.33 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  44.54 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  36.97 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  44.54 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  42.61 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  47.46 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  41.8 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  35.77 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  42.28 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  33.61 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  42.28 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  38.79 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  44.23 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  35.79 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  37.7 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  44.34 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  35.85 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  36.44 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  36.44 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  43.9 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  39.5 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  42.15 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  36.29 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  44.12 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  41.07 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  44.63 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  35.29 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  40 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  42.4 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  37.1 
 
 		 162 aa  67  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  42.59 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  37.5 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2707  crcB protein  37.72 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  45.76 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  40.95 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  39.81 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2385  camphor resistance protein CrcB  46.67 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427512 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  39.02 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  41.86 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  38.68 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  32 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2949  camphor resistance protein CrcB  42.2 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478651  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>