More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1139 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1139  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 294 aa  592  1e-168  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.471247 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  32.64 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  31.3 
 
 		 276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  29.84 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  32.13 
 
 		 288 aa  129  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  29.91 
 
 		 276 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  29.57 
 
 		 275 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  28.57 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  29.15 
 
 		 291 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 277 aa  124  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  30.59 
 
 		 274 aa  123  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  29.84 
 
 		 275 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  29.84 
 
 		 275 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  30.59 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  27.16 
 
 		 270 aa  122  8e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  30.68 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  33.86 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  31.2 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  34.05 
 
 		 330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  29.58 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  27.07 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  28.63 
 
 		 275 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  29.6 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  29.58 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  28.81 
 
 		 274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  28.63 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  27.62 
 
 		 276 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  29.77 
 
 		 298 aa  119  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  30.08 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3051  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0787633 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  29.78 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  31.58 
 
 		 813 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  33.65 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  27.02 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3256  MscS mechanosensitive ion channel  32.6 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00789281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  30.7 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  27.39 
 
 		 274 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  27.85 
 
 		 287 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  28.77 
 
 		 268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  28.84 
 
 		 274 aa  115  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2565  hypothetical protein  30.57 
 
 		 283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5106  MscS mechanosensitive ion channel  32.16 
 
 		 292 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0140126  decreased coverage  0.0019989 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  30.08 
 
 		 267 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  27.35 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  27.53 
 
 		 544 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  30.13 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  31.66 
 
 		 401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 843 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  30.47 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  28.31 
 
 		 280 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 305 aa  112  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  30.29 
 
 		 305 aa  112  6e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  27.84 
 
 		 385 aa  112  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  30.35 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  31.28 
 
 		 360 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  28.92 
 
 		 538 aa  112  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  29.78 
 
 		 540 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2942  MscS mechanosensitive ion channel  31.67 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  27.31 
 
 		 280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  33.51 
 
 		 286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  32.63 
 
 		 331 aa  111  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4989  MscS mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0847315  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3171  MscS mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1189  MscS Mechanosensitive ion channel  33.71 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  26.58 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  27.73 
 
 		 393 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4309  MscS mechanosensitive ion channel  30.51 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000550538  decreased coverage  0.0000000451244 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  31.47 
 
 		 356 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  27.44 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  31.84 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  26.75 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  26.75 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  28.32 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  26.75 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  28.32 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  26.75 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  26.75 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  28.32 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  30.46 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  27.31 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  26.75 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  31.56 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  28.32 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  26.75 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  28.32 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  27.35 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  26.75 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  26.75 
 
 		 291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  29.06 
 
 		 360 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  30.26 
 
 		 549 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  30.26 
 
 		 549 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>