More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02088 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02088  LexA repressor  100 
 
 		 201 aa  393  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2520  LexA repressor  63.18 
 
 		 205 aa  258  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0774546  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3152  LexA repressor  65.35 
 
 		 205 aa  253  9e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2792  LexA repressor  60.7 
 
 		 202 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147289  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3116  LexA repressor  58.71 
 
 		 202 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2601  LexA repressor  58.21 
 
 		 205 aa  227  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2425  LexA repressor  57.71 
 
 		 205 aa  224  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2741  LexA repressor  56.72 
 
 		 205 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00150  LexA repressor  58.65 
 
 		 213 aa  221  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1475  LexA repressor  55.77 
 
 		 211 aa  210  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.457406 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0099  LexA repressor  55.34 
 
 		 211 aa  207  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0085  LexA repressor  54.85 
 
 		 211 aa  206  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00110389  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1483  SOS-response transcriptional repressor, LexA  49.26 
 
 		 261 aa  176  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.639619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3872  LexA repressor  47.52 
 
 		 202 aa  174  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315226  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3599  LexA repressor  47.03 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0155169  normal  0.533875 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2143  LexA repressor  47.03 
 
 		 202 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1683  LexA repressor  47.03 
 
 		 202 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141699  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1659  LexA repressor  46.53 
 
 		 202 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3510  LexA repressor  47.52 
 
 		 202 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9651  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3283  LexA repressor  47.52 
 
 		 202 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1939  LexA repressor  49.49 
 
 		 201 aa  171  9e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269028  normal  0.116637 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0200  LexA repressor  44.33 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1587  LexA repressor  48.06 
 
 		 204 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.477026 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25160  LexA repressor  47.57 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3997  LexA repressor  44.33 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2152  LexA repressor  47.09 
 
 		 204 aa  168  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14510  LexA repressor  44.06 
 
 		 202 aa  167  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3481  LexA repressor  46.57 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3565  LexA repressor  45.16 
 
 		 224 aa  165  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173958  hitchhiker  0.00714221 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2954  LexA repressor  44.44 
 
 		 234 aa  164  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1096  SOS-response transcriptional repressor, LexA  49.25 
 
 		 208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0403674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0180  LexA repressor  44.39 
 
 		 205 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2558  LexA repressor  44.91 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.031889  normal  0.0134465 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0127  LexA repressor  44.33 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1832  transcriptional repressor, LexA family  48.74 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994173 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4912  LexA repressor  45.37 
 
 		 224 aa  161  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2297  LexA repressor  48.74 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0763769  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2636  LexA repressor  44.44 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.270851  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04014  LexA repressor  45.37 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1918  LexA repressor  44.19 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1240  LexA repressor  45.54 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0593225  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03915  LexA repressor  43.84 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.499421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3950  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.84 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1304  LexA repressor  45.75 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4596  LexA repressor  43.84 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4283  LexA repressor  43.84 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4554  LexA repressor  43.84 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4505  LexA repressor  43.84 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2082  LexA repressor  43.95 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.414888 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3985  LexA repressor  43.84 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.359891 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5524  LexA repressor  43.84 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03875  hypothetical protein  43.84 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.453972  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4579  LexA repressor  43.35 
 
 		 202 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1179  LexA repressor  45.54 
 
 		 216 aa  158  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865174  normal  0.239395 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4494  LexA repressor  43.35 
 
 		 202 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4631  LexA repressor  43.35 
 
 		 202 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.381765 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4580  LexA repressor  43.35 
 
 		 202 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.285079 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4429  LexA repressor  43.35 
 
 		 202 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2117  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.69 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357832  hitchhiker  0.000000326173 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2310  LexA repressor  44.44 
 
 		 224 aa  158  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.389414  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1549  LexA repressor  44.44 
 
 		 224 aa  158  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3515  LexA repressor  43.35 
 
 		 205 aa  157  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2423  LexA repressor  42.23 
 
 		 209 aa  157  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1866  LexA repressor  43.78 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.306175  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1300  LexA repressor  44.83 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0237  LexA repressor  43.63 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0247  LexA repressor  42.86 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0945075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2994  LexA repressor  42.59 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.487407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3770  LexA repressor  44.83 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.638288  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3860  LexA repressor  44.83 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.528638  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4247  LexA repressor  45.37 
 
 		 207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0514  LexA repressor  43.84 
 
 		 202 aa  154  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1637  LexA repressor  45.58 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3398  LexA repressor  42.86 
 
 		 203 aa  153  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3524  LexA repressor  43.35 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0733  LexA repressor  43.35 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0418  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.99 
 
 		 239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000022739  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1741  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.81 
 
 		 226 aa  151  5.9999999999999996e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4460  LexA repressor  42.86 
 
 		 202 aa  151  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1787  LexA repressor  43.63 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.916871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1630  LexA repressor  42.99 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2007  LexA repressor  45.23 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.417718  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2008  LexA repressor  41.67 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196928  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2012  LexA repressor  47.15 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1981  LexA repressor  41.2 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0274768 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1120  LexA repressor  44.39 
 
 		 215 aa  148  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1600  LexA repressor  44.39 
 
 		 215 aa  148  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1577  LexA repressor  44.39 
 
 		 215 aa  148  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1211  LexA repressor  47.15 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272184  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1845  LexA repressor  47.15 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0805  LexA repressor  47.15 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1699  LexA repressor  47.15 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.465061  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2481  LexA repressor  47.15 
 
 		 235 aa  148  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147016  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1859  LexA repressor  47.15 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349783  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0356  LexA repressor  47.15 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0456826  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2471  LexA repressor  42.06 
 
 		 216 aa  147  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305758  normal  0.643159 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1516  LexA repressor  43.93 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0386  LexA repressor  41.29 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3862  LexA repressor  44.39 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1496  LexA repressor  43.93 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>