More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1859 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  100 
 
 		 181 aa  370  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  55.11 
 
 		 182 aa  195  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  53.98 
 
 		 210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  53.33 
 
 		 184 aa  192  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  50.28 
 
 		 182 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  51.96 
 
 		 181 aa  191  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  54.49 
 
 		 182 aa  190  7e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  60.11 
 
 		 190 aa  187  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  44.44 
 
 		 187 aa  167  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  44.44 
 
 		 187 aa  167  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  44.44 
 
 		 187 aa  167  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  43.02 
 
 		 181 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  43.33 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  43.33 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  46.29 
 
 		 193 aa  166  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  47.43 
 
 		 193 aa  166  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  43.89 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  50.28 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  42.22 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  42.22 
 
 		 181 aa  164  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  43.33 
 
 		 187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  42.22 
 
 		 181 aa  160  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  50 
 
 		 182 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  43.58 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  42.31 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  52.23 
 
 		 182 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1247  isochorismatase hydrolase  53.63 
 
 		 190 aa  147  8e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.127255  normal  0.527652 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  42.46 
 
 		 184 aa  145  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  35.56 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  41.62 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  39.11 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  42.26 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 313 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0235  isochorismatase hydrolase  37.99 
 
 		 316 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.809907 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  33.15 
 
 		 316 aa  122  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  37.78 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  38.86 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  39.29 
 
 		 196 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  39.29 
 
 		 196 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  39.29 
 
 		 196 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  38.86 
 
 		 201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  37.22 
 
 		 211 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  37.22 
 
 		 211 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  35.59 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  36.11 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  36.57 
 
 		 196 aa  111  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  36.67 
 
 		 203 aa  111  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  41.11 
 
 		 199 aa  111  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  39.29 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 207 aa  107  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  30 
 
 		 180 aa  108  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  41.84 
 
 		 199 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  41.06 
 
 		 199 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  41.06 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  37.29 
 
 		 228 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  34.25 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  37.87 
 
 		 198 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  32.78 
 
 		 342 aa  102  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  35.43 
 
 		 196 aa  100  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 234 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  37.02 
 
 		 217 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  36.46 
 
 		 240 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  38.82 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  35.91 
 
 		 221 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  35.91 
 
 		 221 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  35.84 
 
 		 196 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  36.09 
 
 		 200 aa  98.2  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  39.86 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  39.86 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  39.86 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  37.21 
 
 		 203 aa  95.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  35.23 
 
 		 289 aa  95.5  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  40.24 
 
 		 198 aa  95.5  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  36.09 
 
 		 198 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  31.49 
 
 		 185 aa  94.7  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2640  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 221 aa  94.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4420  isochorismatase hydrolase  40.24 
 
 		 199 aa  94.7  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  39.37 
 
 		 199 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  34.81 
 
 		 248 aa  93.6  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  39.01 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5247  isochorismatase hydrolase  36.9 
 
 		 196 aa  92.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 		 231 aa  92.4  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 		 231 aa  92  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 187 aa  92  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 		 231 aa  92  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 		 231 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  43.48 
 
 		 210 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 172 aa  89  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  34.32 
 
 		 198 aa  89  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  37.5 
 
 		 197 aa  88.6  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  34.93 
 
 		 185 aa  88.2  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 212 aa  88.2  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  32.17 
 
 		 176 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  33.52 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0706  putative isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 		 210 aa  85.9  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2121  isochorismatase hydrolase  31.94 
 
 		 174 aa  85.9  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.29808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 		 201 aa  85.1  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  31.64 
 
 		 193 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>