More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4132 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4132  putative ABC transporter binding protein subunit  100 
 
 		 273 aa  553  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47920  putative binding protein component of ABC transporter  98.53 
 
 		 273 aa  547  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0688655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3868  extracellular solute-binding protein  65.43 
 
 		 268 aa  367  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4864  extracellular solute-binding protein  69.35 
 
 		 268 aa  362  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.950459 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1517  ABC transporter extracellular solute-binding protein  44.06 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0341163  normal  0.209417 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1025  extracellular solute-binding protein  43.14 
 
 		 281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2438  extracellular solute-binding protein  32.79 
 
 		 271 aa  125  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  32.73 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  32.18 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1513  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  33.59 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0012  extracellular solute-binding protein family 3  32.64 
 
 		 275 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  32.08 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2103  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  31.82 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0017  extracellular solute-binding protein family 3  32.23 
 
 		 275 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2073  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 269 aa  115  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.19851 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  31 
 
 		 271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2595  extracellular solute-binding protein family 3  30.92 
 
 		 278 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3746  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 266 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4545  extracellular solute-binding protein family 3  29.41 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.486502  normal  0.0898328 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  31.13 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3691  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.23 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3978  extracellular solute-binding protein  30.19 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5265  extracellular solute-binding protein family 3  29.17 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5541  extracellular solute-binding protein family 3  29.17 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347877 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 265 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7667  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  29.54 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0230  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6374  extracellular solute-binding protein family 3  28.75 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.213399  normal  0.625492 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  31.56 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  30.71 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0449  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0931  extracellular solute-binding protein family 3  28.46 
 
 		 267 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3417  extracellular solute-binding protein family 3  30.43 
 
 		 268 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0211  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0691  extracellular solute-binding protein  32.2 
 
 		 277 aa  105  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  30.3 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  28.98 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4514  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.968225  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1029  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000261026  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  29.58 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6996  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1498  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6331  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483344  normal  0.916228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2071  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5459  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 		 261 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 247 aa  102  7e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 272 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  29.72 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  32.59 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3469  extracellular solute-binding protein family 3  28.73 
 
 		 268 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0375  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3313  extracellular solute-binding protein family 3  27.72 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  28.14 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 266 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2257  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 		 266 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3333  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 275 aa  99.8  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  31.23 
 
 		 271 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4964  extracellular solute-binding protein family 3  29.06 
 
 		 274 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641504  normal  0.0820416 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3130  extracellular solute-binding protein  29.34 
 
 		 263 aa  99  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  32.03 
 
 		 247 aa  99  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3472  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 266 aa  99  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  31.97 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  27.1 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  31.97 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  31.97 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5024  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.09 
 
 		 266 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  30.65 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  31.02 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  32.71 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  30.04 
 
 		 266 aa  96.7  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  32.23 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  31.32 
 
 		 278 aa  96.7  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0306  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 261 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654569  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05402  amino-acid-binding periplasmic ABC transporter protein  28.24 
 
 		 280 aa  96.3  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 		 261 aa  96.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  29.3 
 
 		 247 aa  96.3  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  28.25 
 
 		 266 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0298  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 261 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4898  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 266 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5074  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 		 266 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4927  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 		 266 aa  95.9  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1686  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.06 
 
 		 274 aa  95.9  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175313  normal  0.373626 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0907  extracellular solute-binding protein family 3  28.63 
 
 		 254 aa  95.5  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.6 
 
 		 271 aa  95.5  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2603  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 		 262 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426319  hitchhiker  0.00328337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3673  extracellular solute-binding protein family 3  29.84 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0932  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.214418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0177  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 		 267 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0891  extracellular solute-binding protein family 3  30.74 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.87 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  30.42 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3667  extracellular solute-binding protein family 3  27.31 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.200232  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  39.1 
 
 		 278 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6372  extracellular solute-binding protein family 3  26.24 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5081  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>