More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1328 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  97.52 
 
 
282 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  76.98 
 
 
274 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  75.54 
 
 
274 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  75.29 
 
 
280 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  74.81 
 
 
273 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  74.03 
 
 
274 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  75.19 
 
 
275 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  75.19 
 
 
275 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  75.19 
 
 
275 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  75.19 
 
 
275 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  49.24 
 
 
271 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  50.2 
 
 
263 aa  230  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  50.2 
 
 
322 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  49.8 
 
 
296 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  49.17 
 
 
272 aa  226  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  48.79 
 
 
296 aa  222  6e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  48.58 
 
 
316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  46.99 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  48.8 
 
 
290 aa  210  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  46.53 
 
 
289 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  37.59 
 
 
300 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  37.32 
 
 
300 aa  185  9e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  44.34 
 
 
313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  43.06 
 
 
336 aa  162  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  58.09 
 
 
141 aa  162  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  44.72 
 
 
299 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  43.68 
 
 
280 aa  152  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  38.85 
 
 
336 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  41.62 
 
 
279 aa  149  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  39.18 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  34.48 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  37.5 
 
 
278 aa  146  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  37.23 
 
 
317 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  38.86 
 
 
285 aa  143  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  38.16 
 
 
291 aa  143  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  38.86 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  40.84 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  34.75 
 
 
293 aa  140  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  33.18 
 
 
273 aa  135  5e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  33.18 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  33.49 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  34.05 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  32.29 
 
 
266 aa  133  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  37.08 
 
 
269 aa  132  6e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  37.99 
 
 
282 aa  132  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  36.04 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  37.8 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  32.35 
 
 
328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  39.52 
 
 
312 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  38.04 
 
 
269 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  29.79 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  31.88 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  43.98 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  35.75 
 
 
286 aa  125  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  37.36 
 
 
280 aa  125  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0630  peptidase M23B  35.32 
 
 
312 aa  125  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0558086 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  34.95 
 
 
282 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  38.12 
 
 
306 aa  124  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.33 
 
 
305 aa  123  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  34.29 
 
 
318 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  36.31 
 
 
287 aa  122  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  34.02 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  31.87 
 
 
302 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  34.05 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  37.44 
 
 
283 aa  119  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  35.18 
 
 
294 aa  119  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  36.31 
 
 
306 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  35.2 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  36.31 
 
 
301 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  35.8 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  28.29 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  35.75 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  35.2 
 
 
312 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  35.2 
 
 
313 aa  115  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  34.64 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  34.64 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  35.2 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  34.64 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  47.58 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  37.43 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  41.46 
 
 
316 aa  109  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  38.27 
 
 
301 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  46.28 
 
 
321 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  35.8 
 
 
282 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  39.35 
 
 
375 aa  106  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  31.42 
 
 
286 aa  106  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  45.9 
 
 
300 aa  105  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  42.4 
 
 
284 aa  105  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  37.89 
 
 
305 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  36.47 
 
 
404 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  36.65 
 
 
376 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  37.27 
 
 
305 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  37.27 
 
 
305 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.19 
 
 
304 aa  102  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  40.94 
 
 
411 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  38.85 
 
 
460 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  36.71 
 
 
377 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  41.41 
 
 
308 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  42.52 
 
 
302 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>