140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0987 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0987  HNH nuclease  100 
 
 		 113 aa  234  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.565231  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  91.96 
 
 		 113 aa  218  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307886  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  90.18 
 
 		 113 aa  216  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10571  HNH endonuclease:HNH nuclease  85.71 
 
 		 113 aa  206  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.151449  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0037  HNH nuclease  63.72 
 
 		 131 aa  171  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0033  HNH nuclease  63.72 
 
 		 136 aa  163  8e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0031  HNH nuclease  63.96 
 
 		 133 aa  159  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  63.96 
 
 		 133 aa  158  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  63.06 
 
 		 133 aa  157  4e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575523  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00321  HNH endonuclease:HNH nuclease  60.18 
 
 		 135 aa  157  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.888481  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00361  HNH endonuclease:HNH nuclease  60.18 
 
 		 133 aa  155  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  62.16 
 
 		 133 aa  155  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.285669  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  59.29 
 
 		 136 aa  154  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1358  HNH nuclease  58.41 
 
 		 136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  38.89 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  40.28 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1825  HNH endonuclease  35.37 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00061732  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  38.57 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  43.33 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1393  HNH endonuclease  44.23 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  40.38 
 
 		 205 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  36.59 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  38.57 
 
 		 220 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  42.31 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  44.23 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  41.27 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  44.23 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  42.31 
 
 		 166 aa  53.5  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3842  HNH nuclease  39.44 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20921  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2175  hypothetical protein  37.18 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0666285  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  37.18 
 
 		 198 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  50 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  40.38 
 
 		 222 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  40.38 
 
 		 222 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  40.38 
 
 		 222 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 220 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  37.14 
 
 		 184 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  36.23 
 
 		 222 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2650  HNH endonuclease  41.38 
 
 		 236 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2576  HNH nuclease  38.89 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1603  HNH endonuclease  41.18 
 
 		 186 aa  50.4  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 221 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2932  HNH nuclease  45.1 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.515659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4058  HNH nuclease  34.57 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0476419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 177 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  30.67 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  43.14 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  40.38 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  40 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  31.88 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  43.14 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  31.68 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  35.71 
 
 		 454 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  41.3 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2411  HNH endonuclease  38.81 
 
 		 315 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  45 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3611  HNH nuclease  38.33 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3606  HNH nuclease  38.33 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0985  HNH endonuclease  36.21 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.761066  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3679  HNH nuclease  38.33 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1723  HNH nuclease  40.74 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.921943  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  35.44 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  43.9 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2850  HNH endonuclease  42.11 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.440476  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  32.14 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2783  HNH endonuclease  42 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  47.17 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0936  HNH endonuclease  42 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0423  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3897  HNH endonuclease  37.25 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  39.62 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  40.32 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2070  HNH endonuclease family protein  39.29 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2952  HNH endonuclease family protein  39.22 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  44.9 
 
 		 193 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  39.22 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  37.78 
 
 		 185 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  32.84 
 
 		 1138 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  35.85 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1198  HNH endonuclease  31.88 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.938412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  38.89 
 
 		 194 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  37.78 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  37.78 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  35.85 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2934  HNH endonuclease  40 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0295  hypothetical protein  37.5 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984641 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  33.96 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  34.38 
 
 		 220 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  32.26 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  35.19 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2452  HNH endonuclease  37.93 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  42.22 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3989  HNH endonuclease  44.19 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.519886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1765  HNH endonuclease  37.93 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276107 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  33.77 
 
 		 427 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4626  HNH endonuclease  33.85 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17680  restriction endonuclease  35.06 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  39.53 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>