121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0638 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0638  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06651  Fe-S oxidoreductase  97.42 
 
 
310 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06941  Fe-S oxidoreductases  94.52 
 
 
310 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426586  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07041  Fe-S oxidoreductase  83.23 
 
 
310 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.156574  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07011  Fe-S oxidoreductases  59.68 
 
 
314 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0350076  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0078  hypothetical protein  59.87 
 
 
314 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07461  Fe-S oxidoreductase  56.27 
 
 
311 aa  358  7e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.390345  normal  0.116185 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  50.98 
 
 
317 aa  341  8e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1611  radical SAM family protein  50.65 
 
 
320 aa  338  5e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3555  Radical SAM domain protein  47.09 
 
 
337 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1160  hypothetical protein  52.61 
 
 
322 aa  335  3.9999999999999995e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0590  radical SAM domain-containing protein  52.61 
 
 
317 aa  335  5e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13341  Fe-S oxidoreductase  50.65 
 
 
332 aa  335  5.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1628  putative radical SAM superfamily protein  53.23 
 
 
320 aa  334  1e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346391  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30480  predicted protein  50.99 
 
 
358 aa  332  4e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0866  L-asparaginase II  48.37 
 
 
314 aa  331  1e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  49.54 
 
 
329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  49.03 
 
 
319 aa  323  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  48.7 
 
 
321 aa  322  4e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1763  Radical SAM domain protein  49.19 
 
 
319 aa  319  3e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0283  Radical SAM domain protein  45.32 
 
 
364 aa  318  9e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.716398  normal  0.948397 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13125  predicted protein  48.34 
 
 
308 aa  298  9e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.005765  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0915  Radical SAM domain protein  47.99 
 
 
351 aa  295  5e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0073  Radical SAM domain protein  47.85 
 
 
352 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.127824  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0305  radical SAM domain-containing protein  43.89 
 
 
314 aa  285  5e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  45.54 
 
 
351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  47.12 
 
 
332 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1591  hypothetical protein  43.41 
 
 
344 aa  275  5e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2457  radical SAM family protein  45.67 
 
 
318 aa  275  5e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00277932  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3861  Radical SAM domain protein  45.61 
 
 
327 aa  276  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  45.69 
 
 
328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0945  hypothetical protein  43.45 
 
 
324 aa  273  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3480  radical SAM domain-containing protein  39.8 
 
 
318 aa  271  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  44.19 
 
 
335 aa  266  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05035  hypothetical protein  42.72 
 
 
351 aa  260  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  41.99 
 
 
337 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3751  radical SAM domain-containing protein  43.67 
 
 
337 aa  256  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1925  Radical SAM domain protein  40 
 
 
338 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2614  Radical SAM domain protein  47.87 
 
 
316 aa  246  3e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1312  radical SAM domain-containing protein  38.26 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4113  Radical SAM domain protein  45 
 
 
329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00130178  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4074  Radical SAM domain protein  45 
 
 
329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1566  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 
341 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3171  Radical SAM domain protein  34.92 
 
 
319 aa  219  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1091  Radical SAM domain protein  34.46 
 
 
319 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  35.29 
 
 
459 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 
800 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 
323 aa  56.2  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 
323 aa  55.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  26.51 
 
 
415 aa  54.3  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  26.14 
 
 
405 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  20.21 
 
 
347 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  26.43 
 
 
317 aa  53.9  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  26.39 
 
 
368 aa  53.9  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  27.46 
 
 
422 aa  53.5  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11698  molybdopterin biosynthesis protein moeX  27.74 
 
 
330 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.509473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5883  radical SAM domain-containing protein  22.6 
 
 
332 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.16 
 
 
296 aa  52.8  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  25.76 
 
 
359 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1443  Radical SAM domain protein  21.82 
 
 
440 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.7 
 
 
308 aa  50.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  25.17 
 
 
379 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0890  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 
537 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.93 
 
 
317 aa  50.1  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  19.44 
 
 
391 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  24.68 
 
 
429 aa  50.1  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  25.19 
 
 
326 aa  49.7  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 
468 aa  49.3  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  27.59 
 
 
378 aa  48.5  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  27.95 
 
 
423 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 
368 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3378  hypothetical protein  22.58 
 
 
595 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  26.53 
 
 
365 aa  47.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0419  radical SAM domain-containing protein  28.67 
 
 
337 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  23.65 
 
 
314 aa  47.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 
409 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1210  Radical SAM domain protein  26.58 
 
 
529 aa  47.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  27.95 
 
 
423 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  25.64 
 
 
365 aa  47  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  24.52 
 
 
480 aa  47  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  28.39 
 
 
565 aa  46.6  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  25 
 
 
410 aa  46.2  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  21.26 
 
 
319 aa  46.2  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  21.19 
 
 
348 aa  45.8  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  24.68 
 
 
401 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  29.23 
 
 
345 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  24.68 
 
 
401 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  24.68 
 
 
401 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2549  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
216 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470829  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  21.59 
 
 
358 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18370  predicted Fe-S oxidoreductase  32.94 
 
 
384 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  23.24 
 
 
338 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  22.86 
 
 
399 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.33 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1465  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.67 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0516  radical SAM domain-containing protein  35.38 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 
396 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  22.58 
 
 
364 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2541  Radical SAM domain protein  24.4 
 
 
498 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  22.46 
 
 
397 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>